Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS2

GOT1L1, Putative aspartate aminotransferase, cytoplasmic 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1L1Q8NHS2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOT1L1Q8NHS2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOT1L1Q8NHS2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOT1L1Q8NHS2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOT1L1Q8NHS2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOT1L1Q8NHS2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOT1L1Q8NHS2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOT1L1Q8NHS2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOT1L1Q8NHS2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOT1L1Q8NHS2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOT1L1Q8NHS2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOT1L1Q8NHS2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GOT1L1Q8NHS2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOT1L1Q8NHS2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOT1L1Q8NHS2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOT1L1Q8NHS2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOT1L1Q8NHS2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOT1L1Q8NHS2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOT1L1Q8NHS2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GOT1L1Q8NHS2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOT1L1Q8NHS2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOT1L1Q8NHS2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOT1L1Q8NHS2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOT1L1Q8NHS2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOT1L1Q8NHS2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOT1L1Q8NHS2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOT1L1Q8NHS2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOT1L1Q8NHS2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOT1L1Q8NHS2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOT1L1Q8NHS2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GOT1L1Q8NHS2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOT1L1Q8NHS2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOT1L1Q8NHS2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOT1L1Q8NHS2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOT1L1Q8NHS2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOT1L1Q8NHS2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOT1L1Q8NHS2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOT1L1Q8NHS2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOT1L1Q8NHS2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOT1L1Q8NHS2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GOT1L1Q8NHS2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOT1L1Q8NHS2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOT1L1Q8NHS2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOT1L1Q8NHS2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOT1L1Q8NHS2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOT1L1Q8NHS2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOT1L1Q8NHS2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOT1L1Q8NHS2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOT1L1Q8NHS2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOT1L1Q8NHS2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GOT1L1Q8NHS2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOT1L1Q8NHS2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GOT1L1Q8NHS2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOT1L1Q8NHS2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOT1L1Q8NHS2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOT1L1Q8NHS2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOT1L1Q8NHS2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOT1L1Q8NHS2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOT1L1Q8NHS2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GOT1L1Q8NHS2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOT1L1Q8NHS2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOT1L1Q8NHS2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOT1L1Q8NHS2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOT1L1Q8NHS2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOT1L1Q8NHS2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOT1L1Q8NHS2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOT1L1Q8NHS2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOT1L1Q8NHS2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOT1L1Q8NHS2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOT1L1Q8NHS2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOT1L1Q8NHS2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOT1L1Q8NHS2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOT1L1Q8NHS2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOT1L1Q8NHS2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOT1L1Q8NHS2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOT1L1Q8NHS2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOT1L1Q8NHS2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOT1L1Q8NHS2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOT1L1Q8NHS2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOT1L1Q8NHS2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOT1L1Q8NHS2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOT1L1Q8NHS2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOT1L1Q8NHS2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOT1L1Q8NHS2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOT1L1Q8NHS2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOT1L1Q8NHS2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOT1L1Q8NHS2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOT1L1Q8NHS2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOT1L1Q8NHS2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOT1L1Q8NHS2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GOT1L1Q8NHS2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOT1L1Q8NHS2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOT1L1Q8NHS2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOT1L1Q8NHS2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOT1L1Q8NHS2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOT1L1Q8NHS2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOT1L1Q8NHS2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOT1L1Q8NHS2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOT1L1Q8NHS2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOT1L1Q8NHS2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms