Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DTX3Q8N9I9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DTX3Q8N9I9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DTX3Q8N9I9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DTX3Q8N9I9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DTX3Q8N9I9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DTX3Q8N9I9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DTX3Q8N9I9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DTX3Q8N9I9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DTX3Q8N9I9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DTX3Q8N9I9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DTX3Q8N9I9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DTX3Q8N9I9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DTX3Q8N9I9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DTX3Q8N9I9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DTX3Q8N9I9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DTX3Q8N9I9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DTX3Q8N9I9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DTX3Q8N9I9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DTX3Q8N9I9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DTX3Q8N9I9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DTX3Q8N9I9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DTX3Q8N9I9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DTX3Q8N9I9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DTX3Q8N9I9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DTX3Q8N9I9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DTX3Q8N9I9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DTX3Q8N9I9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DTX3Q8N9I9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DTX3Q8N9I9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DTX3Q8N9I9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DTX3Q8N9I9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DTX3Q8N9I9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DTX3Q8N9I9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTX3Q8N9I9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTX3Q8N9I9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTX3Q8N9I9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTX3Q8N9I9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DTX3Q8N9I9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DTX3Q8N9I9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTX3Q8N9I9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTX3Q8N9I9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTX3Q8N9I9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DTX3Q8N9I9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DTX3Q8N9I9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DTX3Q8N9I9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DTX3Q8N9I9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DTX3Q8N9I9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DTX3Q8N9I9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DTX3Q8N9I9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DTX3Q8N9I9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DTX3Q8N9I9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DTX3Q8N9I9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DTX3Q8N9I9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DTX3Q8N9I9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DTX3Q8N9I9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DTX3Q8N9I9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DTX3Q8N9I9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX3Q8N9I9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX3Q8N9I9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX3Q8N9I9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX3Q8N9I9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX3Q8N9I9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX3Q8N9I9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTX3Q8N9I9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTX3Q8N9I9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTX3Q8N9I9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTX3Q8N9I9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DTX3Q8N9I9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTX3Q8N9I9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTX3Q8N9I9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTX3Q8N9I9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX3Q8N9I9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX3Q8N9I9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms