Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GDPD1Q8N9F7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDPD1Q8N9F7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDPD1Q8N9F7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDPD1Q8N9F7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDPD1Q8N9F7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDPD1Q8N9F7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDPD1Q8N9F7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDPD1Q8N9F7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDPD1Q8N9F7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPD1Q8N9F7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPD1Q8N9F7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPD1Q8N9F7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPD1Q8N9F7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDPD1Q8N9F7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDPD1Q8N9F7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDPD1Q8N9F7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDPD1Q8N9F7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDPD1Q8N9F7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDPD1Q8N9F7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDPD1Q8N9F7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GDPD1Q8N9F7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDPD1Q8N9F7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDPD1Q8N9F7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDPD1Q8N9F7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDPD1Q8N9F7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDPD1Q8N9F7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDPD1Q8N9F7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDPD1Q8N9F7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDPD1Q8N9F7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDPD1Q8N9F7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDPD1Q8N9F7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDPD1Q8N9F7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDPD1Q8N9F7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDPD1Q8N9F7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDPD1Q8N9F7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GDPD1Q8N9F7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDPD1Q8N9F7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDPD1Q8N9F7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDPD1Q8N9F7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDPD1Q8N9F7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDPD1Q8N9F7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDPD1Q8N9F7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDPD1Q8N9F7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDPD1Q8N9F7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDPD1Q8N9F7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDPD1Q8N9F7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDPD1Q8N9F7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDPD1Q8N9F7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD1Q8N9F7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD1Q8N9F7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD1Q8N9F7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD1Q8N9F7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD1Q8N9F7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD1Q8N9F7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GDPD1Q8N9F7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD1Q8N9F7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD1Q8N9F7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD1Q8N9F7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD1Q8N9F7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD1Q8N9F7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD1Q8N9F7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDPD1Q8N9F7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDPD1Q8N9F7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDPD1Q8N9F7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDPD1Q8N9F7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDPD1Q8N9F7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDPD1Q8N9F7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDPD1Q8N9F7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDPD1Q8N9F7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDPD1Q8N9F7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDPD1Q8N9F7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms