Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7P3

CLDN22, Claudin-22, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN22Q8N7P3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN22Q8N7P3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN22Q8N7P3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN22Q8N7P3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN22Q8N7P3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN22Q8N7P3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN22Q8N7P3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN22Q8N7P3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN22Q8N7P3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLDN22Q8N7P3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN22Q8N7P3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN22Q8N7P3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN22Q8N7P3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN22Q8N7P3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN22Q8N7P3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN22Q8N7P3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN22Q8N7P3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN22Q8N7P3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN22Q8N7P3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN22Q8N7P3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN22Q8N7P3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN22Q8N7P3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN22Q8N7P3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN22Q8N7P3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN22Q8N7P3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN22Q8N7P3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN22Q8N7P3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN22Q8N7P3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN22Q8N7P3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN22Q8N7P3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN22Q8N7P3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN22Q8N7P3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN22Q8N7P3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN22Q8N7P3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN22Q8N7P3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN22Q8N7P3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN22Q8N7P3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN22Q8N7P3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN22Q8N7P3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN22Q8N7P3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN22Q8N7P3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN22Q8N7P3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN22Q8N7P3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN22Q8N7P3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN22Q8N7P3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN22Q8N7P3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN22Q8N7P3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN22Q8N7P3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN22Q8N7P3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN22Q8N7P3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN22Q8N7P3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN22Q8N7P3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN22Q8N7P3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN22Q8N7P3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN22Q8N7P3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN22Q8N7P3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN22Q8N7P3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN22Q8N7P3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN22Q8N7P3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN22Q8N7P3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN22Q8N7P3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN22Q8N7P3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN22Q8N7P3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN22Q8N7P3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN22Q8N7P3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN22Q8N7P3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN22Q8N7P3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN22Q8N7P3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN22Q8N7P3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN22Q8N7P3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN22Q8N7P3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN22Q8N7P3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN22Q8N7P3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN22Q8N7P3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN22Q8N7P3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN22Q8N7P3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN22Q8N7P3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN22Q8N7P3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN22Q8N7P3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN22Q8N7P3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN22Q8N7P3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN22Q8N7P3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN22Q8N7P3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN22Q8N7P3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN22Q8N7P3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN22Q8N7P3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN22Q8N7P3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CLDN22Q8N7P3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN22Q8N7P3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN22Q8N7P3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN22Q8N7P3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN22Q8N7P3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN22Q8N7P3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN22Q8N7P3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN22Q8N7P3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN22Q8N7P3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN22Q8N7P3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN22Q8N7P3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN22Q8N7P3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN22Q8N7P3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms