Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO5AQ8N6Q1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO5AQ8N6Q1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO5AQ8N6Q1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO5AQ8N6Q1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO5AQ8N6Q1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO5AQ8N6Q1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMCO5AQ8N6Q1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMCO5AQ8N6Q1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMCO5AQ8N6Q1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMCO5AQ8N6Q1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCO5AQ8N6Q1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCO5AQ8N6Q1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCO5AQ8N6Q1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCO5AQ8N6Q1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCO5AQ8N6Q1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO5AQ8N6Q1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO5AQ8N6Q1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO5AQ8N6Q1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCO5AQ8N6Q1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCO5AQ8N6Q1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCO5AQ8N6Q1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCO5AQ8N6Q1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO5AQ8N6Q1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO5AQ8N6Q1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO5AQ8N6Q1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO5AQ8N6Q1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO5AQ8N6Q1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO5AQ8N6Q1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO5AQ8N6Q1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO5AQ8N6Q1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO5AQ8N6Q1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO5AQ8N6Q1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO5AQ8N6Q1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO5AQ8N6Q1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO5AQ8N6Q1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO5AQ8N6Q1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO5AQ8N6Q1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO5AQ8N6Q1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO5AQ8N6Q1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO5AQ8N6Q1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO5AQ8N6Q1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO5AQ8N6Q1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO5AQ8N6Q1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO5AQ8N6Q1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO5AQ8N6Q1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO5AQ8N6Q1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO5AQ8N6Q1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO5AQ8N6Q1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO5AQ8N6Q1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO5AQ8N6Q1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO5AQ8N6Q1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO5AQ8N6Q1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO5AQ8N6Q1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO5AQ8N6Q1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO5AQ8N6Q1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO5AQ8N6Q1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO5AQ8N6Q1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO5AQ8N6Q1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO5AQ8N6Q1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO5AQ8N6Q1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO5AQ8N6Q1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO5AQ8N6Q1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO5AQ8N6Q1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO5AQ8N6Q1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO5AQ8N6Q1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO5AQ8N6Q1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO5AQ8N6Q1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMCO5AQ8N6Q1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
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