Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLDN19Q8N6F1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDN19Q8N6F1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDN19Q8N6F1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDN19Q8N6F1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDN19Q8N6F1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDN19Q8N6F1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDN19Q8N6F1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLDN19Q8N6F1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLDN19Q8N6F1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN19Q8N6F1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN19Q8N6F1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN19Q8N6F1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN19Q8N6F1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN19Q8N6F1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDN19Q8N6F1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDN19Q8N6F1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDN19Q8N6F1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDN19Q8N6F1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDN19Q8N6F1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDN19Q8N6F1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDN19Q8N6F1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLDN19Q8N6F1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLDN19Q8N6F1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDN19Q8N6F1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDN19Q8N6F1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDN19Q8N6F1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDN19Q8N6F1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN19Q8N6F1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN19Q8N6F1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN19Q8N6F1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN19Q8N6F1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN19Q8N6F1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN19Q8N6F1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN19Q8N6F1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN19Q8N6F1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN19Q8N6F1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN19Q8N6F1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN19Q8N6F1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN19Q8N6F1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN19Q8N6F1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN19Q8N6F1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDN19Q8N6F1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDN19Q8N6F1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN19Q8N6F1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN19Q8N6F1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN19Q8N6F1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN19Q8N6F1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN19Q8N6F1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN19Q8N6F1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN19Q8N6F1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN19Q8N6F1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN19Q8N6F1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN19Q8N6F1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDN19Q8N6F1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDN19Q8N6F1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLDN19Q8N6F1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLDN19Q8N6F1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLDN19Q8N6F1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CLDN19Q8N6F1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLDN19Q8N6F1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN19Q8N6F1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN19Q8N6F1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN19Q8N6F1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN19Q8N6F1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN19Q8N6F1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN19Q8N6F1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN19Q8N6F1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN19Q8N6F1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN19Q8N6F1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN19Q8N6F1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN19Q8N6F1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN19Q8N6F1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN19Q8N6F1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN19Q8N6F1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN19Q8N6F1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN19Q8N6F1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN19Q8N6F1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN19Q8N6F1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN19Q8N6F1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN19Q8N6F1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN19Q8N6F1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN19Q8N6F1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN19Q8N6F1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN19Q8N6F1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN19Q8N6F1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN19Q8N6F1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN19Q8N6F1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN19Q8N6F1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN19Q8N6F1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN19Q8N6F1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN19Q8N6F1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN19Q8N6F1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN19Q8N6F1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN19Q8N6F1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN19Q8N6F1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN19Q8N6F1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN19Q8N6F1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN19Q8N6F1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN19Q8N6F1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms