Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA5B2Q8N398 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA5B2Q8N398 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA5B2Q8N398 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA5B2Q8N398 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA5B2Q8N398 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA5B2Q8N398 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA5B2Q8N398 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA5B2Q8N398 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA5B2Q8N398 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA5B2Q8N398 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA5B2Q8N398 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA5B2Q8N398 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA5B2Q8N398 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA5B2Q8N398 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA5B2Q8N398 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA5B2Q8N398 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWA5B2Q8N398 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWA5B2Q8N398 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA5B2Q8N398 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA5B2Q8N398 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA5B2Q8N398 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA5B2Q8N398 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA5B2Q8N398 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA5B2Q8N398 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA5B2Q8N398 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWA5B2Q8N398 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWA5B2Q8N398 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWA5B2Q8N398 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA5B2Q8N398 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA5B2Q8N398 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA5B2Q8N398 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA5B2Q8N398 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA5B2Q8N398 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA5B2Q8N398 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWA5B2Q8N398 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWA5B2Q8N398 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWA5B2Q8N398 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA5B2Q8N398 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA5B2Q8N398 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA5B2Q8N398 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA5B2Q8N398 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA5B2Q8N398 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA5B2Q8N398 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA5B2Q8N398 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VWA5B2Q8N398 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA5B2Q8N398 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA5B2Q8N398 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA5B2Q8N398 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA5B2Q8N398 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA5B2Q8N398 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA5B2Q8N398 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA5B2Q8N398 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA5B2Q8N398 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA5B2Q8N398 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA5B2Q8N398 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA5B2Q8N398 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VWA5B2Q8N398 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VWA5B2Q8N398 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA5B2Q8N398 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA5B2Q8N398 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA5B2Q8N398 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA5B2Q8N398 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA5B2Q8N398 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA5B2Q8N398 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA5B2Q8N398 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA5B2Q8N398 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA5B2Q8N398 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA5B2Q8N398 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA5B2Q8N398 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA5B2Q8N398 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA5B2Q8N398 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA5B2Q8N398 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA5B2Q8N398 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA5B2Q8N398 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA5B2Q8N398 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA5B2Q8N398 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA5B2Q8N398 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA5B2Q8N398 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA5B2Q8N398 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA5B2Q8N398 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VWA5B2Q8N398 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VWA5B2Q8N398 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms