Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX8

CHERP, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHERPQ8IWX8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHERPQ8IWX8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHERPQ8IWX8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHERPQ8IWX8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHERPQ8IWX8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHERPQ8IWX8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHERPQ8IWX8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHERPQ8IWX8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHERPQ8IWX8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHERPQ8IWX8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHERPQ8IWX8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHERPQ8IWX8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CHERPQ8IWX8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHERPQ8IWX8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHERPQ8IWX8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHERPQ8IWX8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHERPQ8IWX8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHERPQ8IWX8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHERPQ8IWX8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHERPQ8IWX8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHERPQ8IWX8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHERPQ8IWX8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHERPQ8IWX8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHERPQ8IWX8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHERPQ8IWX8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHERPQ8IWX8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHERPQ8IWX8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHERPQ8IWX8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHERPQ8IWX8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHERPQ8IWX8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHERPQ8IWX8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHERPQ8IWX8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHERPQ8IWX8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHERPQ8IWX8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHERPQ8IWX8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHERPQ8IWX8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHERPQ8IWX8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHERPQ8IWX8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHERPQ8IWX8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHERPQ8IWX8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHERPQ8IWX8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHERPQ8IWX8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHERPQ8IWX8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHERPQ8IWX8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHERPQ8IWX8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHERPQ8IWX8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHERPQ8IWX8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHERPQ8IWX8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHERPQ8IWX8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHERPQ8IWX8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHERPQ8IWX8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHERPQ8IWX8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHERPQ8IWX8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHERPQ8IWX8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHERPQ8IWX8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHERPQ8IWX8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHERPQ8IWX8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHERPQ8IWX8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHERPQ8IWX8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHERPQ8IWX8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHERPQ8IWX8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHERPQ8IWX8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHERPQ8IWX8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHERPQ8IWX8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHERPQ8IWX8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHERPQ8IWX8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHERPQ8IWX8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHERPQ8IWX8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHERPQ8IWX8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHERPQ8IWX8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHERPQ8IWX8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHERPQ8IWX8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHERPQ8IWX8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHERPQ8IWX8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHERPQ8IWX8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHERPQ8IWX8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHERPQ8IWX8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHERPQ8IWX8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHERPQ8IWX8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHERPQ8IWX8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHERPQ8IWX8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHERPQ8IWX8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHERPQ8IWX8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHERPQ8IWX8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHERPQ8IWX8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHERPQ8IWX8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHERPQ8IWX8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHERPQ8IWX8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHERPQ8IWX8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHERPQ8IWX8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHERPQ8IWX8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHERPQ8IWX8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHERPQ8IWX8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHERPQ8IWX8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHERPQ8IWX8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHERPQ8IWX8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHERPQ8IWX8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHERPQ8IWX8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHERPQ8IWX8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CHERPQ8IWX8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms