Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APLFQ8IW19 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APLFQ8IW19 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APLFQ8IW19 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APLFQ8IW19 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APLFQ8IW19 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
APLFQ8IW19 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
APLFQ8IW19 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APLFQ8IW19 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APLFQ8IW19 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APLFQ8IW19 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APLFQ8IW19 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APLFQ8IW19 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APLFQ8IW19 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APLFQ8IW19 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APLFQ8IW19 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
APLFQ8IW19 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
APLFQ8IW19 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
APLFQ8IW19 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APLFQ8IW19 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APLFQ8IW19 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APLFQ8IW19 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APLFQ8IW19 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
APLFQ8IW19 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
APLFQ8IW19 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APLFQ8IW19 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APLFQ8IW19 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APLFQ8IW19 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APLFQ8IW19 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APLFQ8IW19 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APLFQ8IW19 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
APLFQ8IW19 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APLFQ8IW19 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APLFQ8IW19 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APLFQ8IW19 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APLFQ8IW19 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APLFQ8IW19 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APLFQ8IW19 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APLFQ8IW19 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
APLFQ8IW19 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
APLFQ8IW19 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APLFQ8IW19 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APLFQ8IW19 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APLFQ8IW19 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
APLFQ8IW19 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APLFQ8IW19 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APLFQ8IW19 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APLFQ8IW19 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APLFQ8IW19 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APLFQ8IW19 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APLFQ8IW19 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APLFQ8IW19 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APLFQ8IW19 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APLFQ8IW19 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APLFQ8IW19 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APLFQ8IW19 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APLFQ8IW19 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APLFQ8IW19 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APLFQ8IW19 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APLFQ8IW19 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APLFQ8IW19 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APLFQ8IW19 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APLFQ8IW19 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APLFQ8IW19 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APLFQ8IW19 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APLFQ8IW19 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APLFQ8IW19 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APLFQ8IW19 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APLFQ8IW19 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APLFQ8IW19 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APLFQ8IW19 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APLFQ8IW19 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APLFQ8IW19 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APLFQ8IW19 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
APLFQ8IW19 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
APLFQ8IW19 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APLFQ8IW19 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APLFQ8IW19 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APLFQ8IW19 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APLFQ8IW19 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
APLFQ8IW19 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APLFQ8IW19 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLFQ8IW19 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLFQ8IW19 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLFQ8IW19 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLFQ8IW19 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLFQ8IW19 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLFQ8IW19 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLFQ8IW19 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLFQ8IW19 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLFQ8IW19 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLFQ8IW19 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLFQ8IW19 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLFQ8IW19 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APLFQ8IW19 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APLFQ8IW19 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
APLFQ8IW19 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLFQ8IW19 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLFQ8IW19 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLFQ8IW19 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms