Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PLD3Q8IV08 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLD3Q8IV08 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLD3Q8IV08 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLD3Q8IV08 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLD3Q8IV08 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLD3Q8IV08 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLD3Q8IV08 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLD3Q8IV08 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PLD3Q8IV08 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLD3Q8IV08 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLD3Q8IV08 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PLD3Q8IV08 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLD3Q8IV08 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLD3Q8IV08 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLD3Q8IV08 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLD3Q8IV08 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLD3Q8IV08 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLD3Q8IV08 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLD3Q8IV08 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLD3Q8IV08 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLD3Q8IV08 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLD3Q8IV08 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLD3Q8IV08 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLD3Q8IV08 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLD3Q8IV08 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLD3Q8IV08 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLD3Q8IV08 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PLD3Q8IV08 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLD3Q8IV08 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLD3Q8IV08 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLD3Q8IV08 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLD3Q8IV08 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLD3Q8IV08 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLD3Q8IV08 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLD3Q8IV08 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLD3Q8IV08 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PLD3Q8IV08 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLD3Q8IV08 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PLD3Q8IV08 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLD3Q8IV08 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLD3Q8IV08 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLD3Q8IV08 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLD3Q8IV08 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLD3Q8IV08 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLD3Q8IV08 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLD3Q8IV08 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLD3Q8IV08 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLD3Q8IV08 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLD3Q8IV08 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLD3Q8IV08 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLD3Q8IV08 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLD3Q8IV08 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLD3Q8IV08 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLD3Q8IV08 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLD3Q8IV08 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLD3Q8IV08 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLD3Q8IV08 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLD3Q8IV08 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLD3Q8IV08 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLD3Q8IV08 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLD3Q8IV08 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLD3Q8IV08 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLD3Q8IV08 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLD3Q8IV08 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLD3Q8IV08 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLD3Q8IV08 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLD3Q8IV08 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLD3Q8IV08 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PLD3Q8IV08 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PLD3Q8IV08 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLD3Q8IV08 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLD3Q8IV08 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLD3Q8IV08 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLD3Q8IV08 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLD3Q8IV08 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLD3Q8IV08 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLD3Q8IV08 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLD3Q8IV08 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLD3Q8IV08 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLD3Q8IV08 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLD3Q8IV08 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLD3Q8IV08 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLD3Q8IV08 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLD3Q8IV08 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLD3Q8IV08 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLD3Q8IV08 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLD3Q8IV08 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLD3Q8IV08 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLD3Q8IV08 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLD3Q8IV08 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLD3Q8IV08 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PLD3Q8IV08 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLD3Q8IV08 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLD3Q8IV08 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLD3Q8IV08 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLD3Q8IV08 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLD3Q8IV08 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLD3Q8IV08 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLD3Q8IV08 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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