Protein–RNA interactions for Protein: Q86X29

LSR, Lipolysis-stimulated lipoprotein receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSRQ86X29 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSRQ86X29 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSRQ86X29 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSRQ86X29 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSRQ86X29 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSRQ86X29 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSRQ86X29 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSRQ86X29 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSRQ86X29 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSRQ86X29 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSRQ86X29 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSRQ86X29 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSRQ86X29 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSRQ86X29 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSRQ86X29 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSRQ86X29 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSRQ86X29 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSRQ86X29 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSRQ86X29 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSRQ86X29 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSRQ86X29 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LSRQ86X29 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSRQ86X29 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LSRQ86X29 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LSRQ86X29 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSRQ86X29 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSRQ86X29 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LSRQ86X29 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSRQ86X29 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSRQ86X29 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSRQ86X29 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSRQ86X29 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSRQ86X29 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSRQ86X29 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSRQ86X29 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSRQ86X29 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSRQ86X29 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSRQ86X29 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LSRQ86X29 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LSRQ86X29 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSRQ86X29 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LSRQ86X29 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LSRQ86X29 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LSRQ86X29 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LSRQ86X29 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSRQ86X29 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSRQ86X29 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSRQ86X29 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSRQ86X29 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSRQ86X29 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSRQ86X29 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSRQ86X29 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSRQ86X29 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSRQ86X29 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSRQ86X29 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSRQ86X29 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSRQ86X29 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSRQ86X29 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSRQ86X29 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSRQ86X29 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSRQ86X29 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSRQ86X29 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSRQ86X29 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LSRQ86X29 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSRQ86X29 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSRQ86X29 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSRQ86X29 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSRQ86X29 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSRQ86X29 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSRQ86X29 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSRQ86X29 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSRQ86X29 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSRQ86X29 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms