Protein–RNA interactions for Protein: Q86T82

USP37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP37Q86T82 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP37Q86T82 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP37Q86T82 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP37Q86T82 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP37Q86T82 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP37Q86T82 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP37Q86T82 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP37Q86T82 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP37Q86T82 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
USP37Q86T82 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP37Q86T82 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP37Q86T82 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP37Q86T82 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP37Q86T82 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP37Q86T82 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP37Q86T82 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP37Q86T82 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP37Q86T82 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP37Q86T82 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP37Q86T82 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP37Q86T82 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP37Q86T82 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP37Q86T82 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
USP37Q86T82 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP37Q86T82 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP37Q86T82 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP37Q86T82 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP37Q86T82 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP37Q86T82 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP37Q86T82 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP37Q86T82 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP37Q86T82 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP37Q86T82 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP37Q86T82 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP37Q86T82 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP37Q86T82 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP37Q86T82 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP37Q86T82 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP37Q86T82 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP37Q86T82 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP37Q86T82 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP37Q86T82 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP37Q86T82 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP37Q86T82 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP37Q86T82 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP37Q86T82 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP37Q86T82 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP37Q86T82 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP37Q86T82 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP37Q86T82 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP37Q86T82 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP37Q86T82 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP37Q86T82 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP37Q86T82 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP37Q86T82 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP37Q86T82 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP37Q86T82 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP37Q86T82 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
USP37Q86T82 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP37Q86T82 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP37Q86T82 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP37Q86T82 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP37Q86T82 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP37Q86T82 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP37Q86T82 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP37Q86T82 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP37Q86T82 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP37Q86T82 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP37Q86T82 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP37Q86T82 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP37Q86T82 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP37Q86T82 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP37Q86T82 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP37Q86T82 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP37Q86T82 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP37Q86T82 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP37Q86T82 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP37Q86T82 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP37Q86T82 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
USP37Q86T82 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP37Q86T82 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP37Q86T82 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP37Q86T82 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP37Q86T82 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP37Q86T82 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP37Q86T82 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP37Q86T82 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP37Q86T82 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP37Q86T82 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP37Q86T82 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP37Q86T82 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP37Q86T82 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP37Q86T82 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP37Q86T82 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
USP37Q86T82 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP37Q86T82 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
USP37Q86T82 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP37Q86T82 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP37Q86T82 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP37Q86T82 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms