Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
YTHDF3Q7Z739 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
YTHDF3Q7Z739 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
YTHDF3Q7Z739 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
YTHDF3Q7Z739 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
YTHDF3Q7Z739 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
YTHDF3Q7Z739 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YTHDF3Q7Z739 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YTHDF3Q7Z739 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YTHDF3Q7Z739 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YTHDF3Q7Z739 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
YTHDF3Q7Z739 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YTHDF3Q7Z739 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
YTHDF3Q7Z739 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
YTHDF3Q7Z739 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
YTHDF3Q7Z739 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
YTHDF3Q7Z739 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
YTHDF3Q7Z739 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
YTHDF3Q7Z739 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
YTHDF3Q7Z739 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
YTHDF3Q7Z739 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
YTHDF3Q7Z739 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
YTHDF3Q7Z739 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
YTHDF3Q7Z739 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
YTHDF3Q7Z739 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
YTHDF3Q7Z739 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
YTHDF3Q7Z739 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDF3Q7Z739 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDF3Q7Z739 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDF3Q7Z739 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
YTHDF3Q7Z739 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
YTHDF3Q7Z739 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDF3Q7Z739 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDF3Q7Z739 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDF3Q7Z739 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDF3Q7Z739 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDF3Q7Z739 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDF3Q7Z739 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
YTHDF3Q7Z739 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
YTHDF3Q7Z739 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YTHDF3Q7Z739 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDF3Q7Z739 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDF3Q7Z739 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDF3Q7Z739 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDF3Q7Z739 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDF3Q7Z739 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDF3Q7Z739 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDF3Q7Z739 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDF3Q7Z739 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDF3Q7Z739 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDF3Q7Z739 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDF3Q7Z739 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDF3Q7Z739 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDF3Q7Z739 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDF3Q7Z739 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDF3Q7Z739 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDF3Q7Z739 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDF3Q7Z739 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDF3Q7Z739 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDF3Q7Z739 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDF3Q7Z739 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
YTHDF3Q7Z739 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
YTHDF3Q7Z739 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
YTHDF3Q7Z739 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
YTHDF3Q7Z739 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
YTHDF3Q7Z739 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
YTHDF3Q7Z739 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
YTHDF3Q7Z739 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YTHDF3Q7Z739 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YTHDF3Q7Z739 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YTHDF3Q7Z739 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YTHDF3Q7Z739 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDF3Q7Z739 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDF3Q7Z739 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDF3Q7Z739 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDF3Q7Z739 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YTHDF3Q7Z739 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YTHDF3Q7Z739 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YTHDF3Q7Z739 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YTHDF3Q7Z739 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YTHDF3Q7Z739 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YTHDF3Q7Z739 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
YTHDF3Q7Z739 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
YTHDF3Q7Z739 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
YTHDF3Q7Z739 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YTHDF3Q7Z739 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YTHDF3Q7Z739 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YTHDF3Q7Z739 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
YTHDF3Q7Z739 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YTHDF3Q7Z739 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
YTHDF3Q7Z739 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YTHDF3Q7Z739 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YTHDF3Q7Z739 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDF3Q7Z739 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDF3Q7Z739 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDF3Q7Z739 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
YTHDF3Q7Z739 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YTHDF3Q7Z739 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YTHDF3Q7Z739 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YTHDF3Q7Z739 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms