Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2H8

SLC36A1, Proton-coupled amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A1Q7Z2H8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A1Q7Z2H8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A1Q7Z2H8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC36A1Q7Z2H8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC36A1Q7Z2H8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC36A1Q7Z2H8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC36A1Q7Z2H8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC36A1Q7Z2H8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC36A1Q7Z2H8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC36A1Q7Z2H8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC36A1Q7Z2H8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC36A1Q7Z2H8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC36A1Q7Z2H8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC36A1Q7Z2H8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC36A1Q7Z2H8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC36A1Q7Z2H8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A1Q7Z2H8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A1Q7Z2H8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A1Q7Z2H8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A1Q7Z2H8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A1Q7Z2H8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A1Q7Z2H8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A1Q7Z2H8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A1Q7Z2H8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC36A1Q7Z2H8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC36A1Q7Z2H8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC36A1Q7Z2H8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC36A1Q7Z2H8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC36A1Q7Z2H8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC36A1Q7Z2H8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC36A1Q7Z2H8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC36A1Q7Z2H8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC36A1Q7Z2H8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC36A1Q7Z2H8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC36A1Q7Z2H8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC36A1Q7Z2H8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC36A1Q7Z2H8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC36A1Q7Z2H8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC36A1Q7Z2H8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC36A1Q7Z2H8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC36A1Q7Z2H8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC36A1Q7Z2H8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC36A1Q7Z2H8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC36A1Q7Z2H8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC36A1Q7Z2H8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC36A1Q7Z2H8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC36A1Q7Z2H8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC36A1Q7Z2H8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC36A1Q7Z2H8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC36A1Q7Z2H8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC36A1Q7Z2H8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC36A1Q7Z2H8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC36A1Q7Z2H8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC36A1Q7Z2H8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC36A1Q7Z2H8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC36A1Q7Z2H8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC36A1Q7Z2H8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC36A1Q7Z2H8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC36A1Q7Z2H8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC36A1Q7Z2H8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC36A1Q7Z2H8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC36A1Q7Z2H8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC36A1Q7Z2H8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC36A1Q7Z2H8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC36A1Q7Z2H8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC36A1Q7Z2H8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC36A1Q7Z2H8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC36A1Q7Z2H8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC36A1Q7Z2H8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC36A1Q7Z2H8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC36A1Q7Z2H8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC36A1Q7Z2H8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC36A1Q7Z2H8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC36A1Q7Z2H8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC36A1Q7Z2H8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC36A1Q7Z2H8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC36A1Q7Z2H8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC36A1Q7Z2H8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC36A1Q7Z2H8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC36A1Q7Z2H8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC36A1Q7Z2H8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC36A1Q7Z2H8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A1Q7Z2H8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A1Q7Z2H8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A1Q7Z2H8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A1Q7Z2H8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A1Q7Z2H8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A1Q7Z2H8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A1Q7Z2H8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC36A1Q7Z2H8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC36A1Q7Z2H8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC36A1Q7Z2H8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC36A1Q7Z2H8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC36A1Q7Z2H8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC36A1Q7Z2H8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC36A1Q7Z2H8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC36A1Q7Z2H8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC36A1Q7Z2H8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC36A1Q7Z2H8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC36A1Q7Z2H8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms