Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLRC3Q7RTR2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRC3Q7RTR2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRC3Q7RTR2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRC3Q7RTR2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRC3Q7RTR2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRC3Q7RTR2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRC3Q7RTR2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRC3Q7RTR2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRC3Q7RTR2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRC3Q7RTR2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRC3Q7RTR2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRC3Q7RTR2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRC3Q7RTR2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRC3Q7RTR2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRC3Q7RTR2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NLRC3Q7RTR2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRC3Q7RTR2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRC3Q7RTR2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRC3Q7RTR2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRC3Q7RTR2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRC3Q7RTR2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC3Q7RTR2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC3Q7RTR2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC3Q7RTR2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC3Q7RTR2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC3Q7RTR2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC3Q7RTR2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRC3Q7RTR2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRC3Q7RTR2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRC3Q7RTR2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRC3Q7RTR2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRC3Q7RTR2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRC3Q7RTR2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRC3Q7RTR2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRC3Q7RTR2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRC3Q7RTR2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRC3Q7RTR2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRC3Q7RTR2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRC3Q7RTR2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms