Protein–RNA interactions for Protein: Q71UM5

RPS27L, 40S ribosomal protein S27-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27LQ71UM5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPS27LQ71UM5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPS27LQ71UM5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS27LQ71UM5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS27LQ71UM5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS27LQ71UM5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS27LQ71UM5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS27LQ71UM5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS27LQ71UM5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS27LQ71UM5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS27LQ71UM5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS27LQ71UM5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS27LQ71UM5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPS27LQ71UM5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPS27LQ71UM5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPS27LQ71UM5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPS27LQ71UM5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPS27LQ71UM5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPS27LQ71UM5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPS27LQ71UM5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPS27LQ71UM5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPS27LQ71UM5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RPS27LQ71UM5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPS27LQ71UM5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPS27LQ71UM5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPS27LQ71UM5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPS27LQ71UM5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPS27LQ71UM5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPS27LQ71UM5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPS27LQ71UM5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPS27LQ71UM5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPS27LQ71UM5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPS27LQ71UM5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPS27LQ71UM5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPS27LQ71UM5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPS27LQ71UM5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPS27LQ71UM5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPS27LQ71UM5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPS27LQ71UM5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS27LQ71UM5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS27LQ71UM5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS27LQ71UM5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS27LQ71UM5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS27LQ71UM5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS27LQ71UM5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS27LQ71UM5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS27LQ71UM5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPS27LQ71UM5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS27LQ71UM5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS27LQ71UM5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS27LQ71UM5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS27LQ71UM5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS27LQ71UM5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS27LQ71UM5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS27LQ71UM5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS27LQ71UM5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS27LQ71UM5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS27LQ71UM5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS27LQ71UM5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS27LQ71UM5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS27LQ71UM5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS27LQ71UM5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS27LQ71UM5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS27LQ71UM5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS27LQ71UM5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS27LQ71UM5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS27LQ71UM5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS27LQ71UM5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS27LQ71UM5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS27LQ71UM5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS27LQ71UM5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS27LQ71UM5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS27LQ71UM5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS27LQ71UM5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS27LQ71UM5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS27LQ71UM5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS27LQ71UM5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS27LQ71UM5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS27LQ71UM5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS27LQ71UM5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS27LQ71UM5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS27LQ71UM5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS27LQ71UM5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS27LQ71UM5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS27LQ71UM5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS27LQ71UM5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS27LQ71UM5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS27LQ71UM5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS27LQ71UM5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS27LQ71UM5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS27LQ71UM5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS27LQ71UM5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS27LQ71UM5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS27LQ71UM5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS27LQ71UM5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS27LQ71UM5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS27LQ71UM5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS27LQ71UM5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS27LQ71UM5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS27LQ71UM5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms