Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUFY4Q6ZNE9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RUFY4Q6ZNE9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RUFY4Q6ZNE9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RUFY4Q6ZNE9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RUFY4Q6ZNE9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RUFY4Q6ZNE9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RUFY4Q6ZNE9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RUFY4Q6ZNE9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RUFY4Q6ZNE9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RUFY4Q6ZNE9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RUFY4Q6ZNE9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RUFY4Q6ZNE9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RUFY4Q6ZNE9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RUFY4Q6ZNE9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RUFY4Q6ZNE9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RUFY4Q6ZNE9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RUFY4Q6ZNE9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RUFY4Q6ZNE9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUFY4Q6ZNE9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUFY4Q6ZNE9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUFY4Q6ZNE9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUFY4Q6ZNE9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RUFY4Q6ZNE9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RUFY4Q6ZNE9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RUFY4Q6ZNE9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RUFY4Q6ZNE9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RUFY4Q6ZNE9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RUFY4Q6ZNE9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RUFY4Q6ZNE9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RUFY4Q6ZNE9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RUFY4Q6ZNE9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RUFY4Q6ZNE9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RUFY4Q6ZNE9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RUFY4Q6ZNE9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RUFY4Q6ZNE9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RUFY4Q6ZNE9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RUFY4Q6ZNE9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RUFY4Q6ZNE9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RUFY4Q6ZNE9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RUFY4Q6ZNE9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RUFY4Q6ZNE9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RUFY4Q6ZNE9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RUFY4Q6ZNE9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RUFY4Q6ZNE9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RUFY4Q6ZNE9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RUFY4Q6ZNE9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RUFY4Q6ZNE9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RUFY4Q6ZNE9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RUFY4Q6ZNE9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RUFY4Q6ZNE9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RUFY4Q6ZNE9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RUFY4Q6ZNE9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RUFY4Q6ZNE9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RUFY4Q6ZNE9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RUFY4Q6ZNE9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RUFY4Q6ZNE9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RUFY4Q6ZNE9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RUFY4Q6ZNE9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RUFY4Q6ZNE9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RUFY4Q6ZNE9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RUFY4Q6ZNE9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RUFY4Q6ZNE9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RUFY4Q6ZNE9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RUFY4Q6ZNE9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RUFY4Q6ZNE9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUFY4Q6ZNE9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUFY4Q6ZNE9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUFY4Q6ZNE9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RUFY4Q6ZNE9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RUFY4Q6ZNE9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RUFY4Q6ZNE9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RUFY4Q6ZNE9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RUFY4Q6ZNE9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RUFY4Q6ZNE9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RUFY4Q6ZNE9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RUFY4Q6ZNE9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RUFY4Q6ZNE9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RUFY4Q6ZNE9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RUFY4Q6ZNE9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RUFY4Q6ZNE9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUFY4Q6ZNE9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUFY4Q6ZNE9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RUFY4Q6ZNE9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RUFY4Q6ZNE9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RUFY4Q6ZNE9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RUFY4Q6ZNE9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RUFY4Q6ZNE9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RUFY4Q6ZNE9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUFY4Q6ZNE9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUFY4Q6ZNE9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RUFY4Q6ZNE9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RUFY4Q6ZNE9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUFY4Q6ZNE9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUFY4Q6ZNE9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUFY4Q6ZNE9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUFY4Q6ZNE9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUFY4Q6ZNE9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RUFY4Q6ZNE9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RUFY4Q6ZNE9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 307.4 ms