Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN54

DEF8, Differentially expressed in FDCP 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEF8Q6ZN54 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEF8Q6ZN54 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEF8Q6ZN54 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEF8Q6ZN54 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEF8Q6ZN54 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DEF8Q6ZN54 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DEF8Q6ZN54 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEF8Q6ZN54 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DEF8Q6ZN54 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEF8Q6ZN54 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEF8Q6ZN54 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEF8Q6ZN54 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEF8Q6ZN54 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DEF8Q6ZN54 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DEF8Q6ZN54 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DEF8Q6ZN54 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DEF8Q6ZN54 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEF8Q6ZN54 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEF8Q6ZN54 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEF8Q6ZN54 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEF8Q6ZN54 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEF8Q6ZN54 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEF8Q6ZN54 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEF8Q6ZN54 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEF8Q6ZN54 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEF8Q6ZN54 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DEF8Q6ZN54 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEF8Q6ZN54 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEF8Q6ZN54 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DEF8Q6ZN54 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEF8Q6ZN54 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEF8Q6ZN54 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEF8Q6ZN54 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEF8Q6ZN54 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DEF8Q6ZN54 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEF8Q6ZN54 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DEF8Q6ZN54 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEF8Q6ZN54 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEF8Q6ZN54 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEF8Q6ZN54 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEF8Q6ZN54 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEF8Q6ZN54 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEF8Q6ZN54 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEF8Q6ZN54 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEF8Q6ZN54 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEF8Q6ZN54 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEF8Q6ZN54 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DEF8Q6ZN54 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEF8Q6ZN54 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEF8Q6ZN54 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEF8Q6ZN54 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEF8Q6ZN54 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEF8Q6ZN54 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEF8Q6ZN54 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEF8Q6ZN54 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEF8Q6ZN54 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEF8Q6ZN54 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEF8Q6ZN54 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEF8Q6ZN54 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEF8Q6ZN54 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEF8Q6ZN54 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEF8Q6ZN54 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEF8Q6ZN54 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEF8Q6ZN54 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEF8Q6ZN54 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEF8Q6ZN54 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEF8Q6ZN54 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEF8Q6ZN54 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEF8Q6ZN54 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEF8Q6ZN54 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEF8Q6ZN54 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DEF8Q6ZN54 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEF8Q6ZN54 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEF8Q6ZN54 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEF8Q6ZN54 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEF8Q6ZN54 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEF8Q6ZN54 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEF8Q6ZN54 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEF8Q6ZN54 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEF8Q6ZN54 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEF8Q6ZN54 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEF8Q6ZN54 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DEF8Q6ZN54 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DEF8Q6ZN54 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DEF8Q6ZN54 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DEF8Q6ZN54 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DEF8Q6ZN54 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DEF8Q6ZN54 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEF8Q6ZN54 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEF8Q6ZN54 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEF8Q6ZN54 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEF8Q6ZN54 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEF8Q6ZN54 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEF8Q6ZN54 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEF8Q6ZN54 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEF8Q6ZN54 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEF8Q6ZN54 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEF8Q6ZN54 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DEF8Q6ZN54 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DEF8Q6ZN54 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms