Protein–RNA interactions for Protein: Q6QEF8

CORO6, Coronin-6, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CORO6Q6QEF8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CORO6Q6QEF8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CORO6Q6QEF8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CORO6Q6QEF8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CORO6Q6QEF8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CORO6Q6QEF8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CORO6Q6QEF8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CORO6Q6QEF8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CORO6Q6QEF8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CORO6Q6QEF8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CORO6Q6QEF8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CORO6Q6QEF8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CORO6Q6QEF8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CORO6Q6QEF8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CORO6Q6QEF8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CORO6Q6QEF8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CORO6Q6QEF8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CORO6Q6QEF8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CORO6Q6QEF8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CORO6Q6QEF8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CORO6Q6QEF8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CORO6Q6QEF8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CORO6Q6QEF8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CORO6Q6QEF8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CORO6Q6QEF8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CORO6Q6QEF8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CORO6Q6QEF8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CORO6Q6QEF8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CORO6Q6QEF8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CORO6Q6QEF8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CORO6Q6QEF8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CORO6Q6QEF8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CORO6Q6QEF8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CORO6Q6QEF8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CORO6Q6QEF8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CORO6Q6QEF8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CORO6Q6QEF8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CORO6Q6QEF8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CORO6Q6QEF8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CORO6Q6QEF8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CORO6Q6QEF8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CORO6Q6QEF8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CORO6Q6QEF8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CORO6Q6QEF8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CORO6Q6QEF8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CORO6Q6QEF8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CORO6Q6QEF8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CORO6Q6QEF8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CORO6Q6QEF8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CORO6Q6QEF8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CORO6Q6QEF8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CORO6Q6QEF8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CORO6Q6QEF8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CORO6Q6QEF8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CORO6Q6QEF8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CORO6Q6QEF8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CORO6Q6QEF8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CORO6Q6QEF8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CORO6Q6QEF8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CORO6Q6QEF8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CORO6Q6QEF8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CORO6Q6QEF8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CORO6Q6QEF8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CORO6Q6QEF8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CORO6Q6QEF8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CORO6Q6QEF8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CORO6Q6QEF8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CORO6Q6QEF8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CORO6Q6QEF8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CORO6Q6QEF8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CORO6Q6QEF8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms