Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNDC11Q6PKC3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNDC11Q6PKC3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNDC11Q6PKC3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNDC11Q6PKC3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNDC11Q6PKC3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNDC11Q6PKC3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNDC11Q6PKC3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNDC11Q6PKC3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TXNDC11Q6PKC3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TXNDC11Q6PKC3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TXNDC11Q6PKC3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TXNDC11Q6PKC3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TXNDC11Q6PKC3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TXNDC11Q6PKC3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TXNDC11Q6PKC3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TXNDC11Q6PKC3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TXNDC11Q6PKC3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TXNDC11Q6PKC3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TXNDC11Q6PKC3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TXNDC11Q6PKC3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TXNDC11Q6PKC3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TXNDC11Q6PKC3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TXNDC11Q6PKC3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TXNDC11Q6PKC3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TXNDC11Q6PKC3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TXNDC11Q6PKC3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TXNDC11Q6PKC3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TXNDC11Q6PKC3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TXNDC11Q6PKC3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TXNDC11Q6PKC3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TXNDC11Q6PKC3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNDC11Q6PKC3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC11Q6PKC3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC11Q6PKC3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC11Q6PKC3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC11Q6PKC3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TXNDC11Q6PKC3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC11Q6PKC3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC11Q6PKC3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC11Q6PKC3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXNDC11Q6PKC3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXNDC11Q6PKC3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXNDC11Q6PKC3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXNDC11Q6PKC3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXNDC11Q6PKC3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXNDC11Q6PKC3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TXNDC11Q6PKC3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TXNDC11Q6PKC3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TXNDC11Q6PKC3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TXNDC11Q6PKC3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TXNDC11Q6PKC3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TXNDC11Q6PKC3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TXNDC11Q6PKC3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TXNDC11Q6PKC3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TXNDC11Q6PKC3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TXNDC11Q6PKC3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TXNDC11Q6PKC3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TXNDC11Q6PKC3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TXNDC11Q6PKC3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TXNDC11Q6PKC3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TXNDC11Q6PKC3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TXNDC11Q6PKC3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TXNDC11Q6PKC3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TXNDC11Q6PKC3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TXNDC11Q6PKC3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TXNDC11Q6PKC3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TXNDC11Q6PKC3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TXNDC11Q6PKC3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TXNDC11Q6PKC3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TXNDC11Q6PKC3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TXNDC11Q6PKC3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TXNDC11Q6PKC3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms