Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL35Q6PF15 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL35Q6PF15 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL35Q6PF15 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL35Q6PF15 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL35Q6PF15 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL35Q6PF15 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL35Q6PF15 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL35Q6PF15 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL35Q6PF15 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL35Q6PF15 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL35Q6PF15 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL35Q6PF15 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL35Q6PF15 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL35Q6PF15 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL35Q6PF15 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL35Q6PF15 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL35Q6PF15 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL35Q6PF15 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KLHL35Q6PF15 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL35Q6PF15 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL35Q6PF15 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL35Q6PF15 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL35Q6PF15 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL35Q6PF15 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL35Q6PF15 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL35Q6PF15 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL35Q6PF15 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL35Q6PF15 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL35Q6PF15 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL35Q6PF15 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL35Q6PF15 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL35Q6PF15 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL35Q6PF15 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL35Q6PF15 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL35Q6PF15 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL35Q6PF15 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL35Q6PF15 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL35Q6PF15 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL35Q6PF15 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL35Q6PF15 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL35Q6PF15 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL35Q6PF15 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL35Q6PF15 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL35Q6PF15 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL35Q6PF15 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL35Q6PF15 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL35Q6PF15 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL35Q6PF15 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL35Q6PF15 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL35Q6PF15 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL35Q6PF15 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL35Q6PF15 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KLHL35Q6PF15 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL35Q6PF15 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL35Q6PF15 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL35Q6PF15 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL35Q6PF15 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL35Q6PF15 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL35Q6PF15 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL35Q6PF15 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL35Q6PF15 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL35Q6PF15 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL35Q6PF15 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL35Q6PF15 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL35Q6PF15 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL35Q6PF15 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL35Q6PF15 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL35Q6PF15 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL35Q6PF15 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL35Q6PF15 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms