Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF549Q6P9A3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF549Q6P9A3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF549Q6P9A3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF549Q6P9A3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF549Q6P9A3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF549Q6P9A3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF549Q6P9A3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF549Q6P9A3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF549Q6P9A3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF549Q6P9A3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF549Q6P9A3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF549Q6P9A3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF549Q6P9A3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF549Q6P9A3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF549Q6P9A3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF549Q6P9A3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF549Q6P9A3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF549Q6P9A3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF549Q6P9A3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF549Q6P9A3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF549Q6P9A3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF549Q6P9A3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF549Q6P9A3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF549Q6P9A3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF549Q6P9A3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF549Q6P9A3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF549Q6P9A3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF549Q6P9A3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF549Q6P9A3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF549Q6P9A3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF549Q6P9A3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF549Q6P9A3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF549Q6P9A3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF549Q6P9A3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF549Q6P9A3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF549Q6P9A3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF549Q6P9A3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF549Q6P9A3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF549Q6P9A3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF549Q6P9A3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF549Q6P9A3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF549Q6P9A3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF549Q6P9A3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF549Q6P9A3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF549Q6P9A3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF549Q6P9A3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF549Q6P9A3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF549Q6P9A3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF549Q6P9A3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF549Q6P9A3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF549Q6P9A3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF549Q6P9A3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF549Q6P9A3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF549Q6P9A3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF549Q6P9A3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF549Q6P9A3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF549Q6P9A3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF549Q6P9A3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF549Q6P9A3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF549Q6P9A3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF549Q6P9A3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF549Q6P9A3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF549Q6P9A3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF549Q6P9A3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF549Q6P9A3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF549Q6P9A3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF549Q6P9A3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF549Q6P9A3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF549Q6P9A3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF549Q6P9A3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF549Q6P9A3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF549Q6P9A3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF549Q6P9A3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF549Q6P9A3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF549Q6P9A3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF549Q6P9A3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF549Q6P9A3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF549Q6P9A3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF549Q6P9A3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF549Q6P9A3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF549Q6P9A3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF549Q6P9A3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF549Q6P9A3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF549Q6P9A3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZNF549Q6P9A3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF549Q6P9A3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF549Q6P9A3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF549Q6P9A3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF549Q6P9A3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF549Q6P9A3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF549Q6P9A3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF549Q6P9A3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF549Q6P9A3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF549Q6P9A3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF549Q6P9A3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF549Q6P9A3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF549Q6P9A3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF549Q6P9A3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF549Q6P9A3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms