Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO42Q6P3S6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO42Q6P3S6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO42Q6P3S6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO42Q6P3S6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO42Q6P3S6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO42Q6P3S6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO42Q6P3S6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO42Q6P3S6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO42Q6P3S6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO42Q6P3S6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO42Q6P3S6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO42Q6P3S6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO42Q6P3S6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO42Q6P3S6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO42Q6P3S6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO42Q6P3S6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO42Q6P3S6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO42Q6P3S6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO42Q6P3S6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO42Q6P3S6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO42Q6P3S6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO42Q6P3S6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO42Q6P3S6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO42Q6P3S6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO42Q6P3S6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO42Q6P3S6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO42Q6P3S6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO42Q6P3S6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO42Q6P3S6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO42Q6P3S6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO42Q6P3S6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO42Q6P3S6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO42Q6P3S6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO42Q6P3S6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FBXO42Q6P3S6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO42Q6P3S6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO42Q6P3S6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO42Q6P3S6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO42Q6P3S6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO42Q6P3S6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO42Q6P3S6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO42Q6P3S6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO42Q6P3S6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO42Q6P3S6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO42Q6P3S6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO42Q6P3S6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO42Q6P3S6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO42Q6P3S6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO42Q6P3S6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO42Q6P3S6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO42Q6P3S6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO42Q6P3S6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO42Q6P3S6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO42Q6P3S6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO42Q6P3S6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO42Q6P3S6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO42Q6P3S6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO42Q6P3S6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO42Q6P3S6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO42Q6P3S6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO42Q6P3S6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO42Q6P3S6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO42Q6P3S6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO42Q6P3S6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO42Q6P3S6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO42Q6P3S6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO42Q6P3S6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FBXO42Q6P3S6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO42Q6P3S6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO42Q6P3S6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO42Q6P3S6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO42Q6P3S6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO42Q6P3S6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO42Q6P3S6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO42Q6P3S6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO42Q6P3S6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO42Q6P3S6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO42Q6P3S6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO42Q6P3S6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO42Q6P3S6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO42Q6P3S6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO42Q6P3S6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO42Q6P3S6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO42Q6P3S6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO42Q6P3S6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO42Q6P3S6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO42Q6P3S6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO42Q6P3S6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO42Q6P3S6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO42Q6P3S6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO42Q6P3S6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO42Q6P3S6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO42Q6P3S6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO42Q6P3S6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO42Q6P3S6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO42Q6P3S6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO42Q6P3S6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO42Q6P3S6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO42Q6P3S6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms