Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2H8

TMEM53, Transmembrane protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM53Q6P2H8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM53Q6P2H8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM53Q6P2H8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM53Q6P2H8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM53Q6P2H8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM53Q6P2H8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM53Q6P2H8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM53Q6P2H8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM53Q6P2H8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM53Q6P2H8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM53Q6P2H8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM53Q6P2H8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM53Q6P2H8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM53Q6P2H8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM53Q6P2H8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM53Q6P2H8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM53Q6P2H8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM53Q6P2H8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM53Q6P2H8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM53Q6P2H8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM53Q6P2H8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM53Q6P2H8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM53Q6P2H8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM53Q6P2H8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM53Q6P2H8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM53Q6P2H8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM53Q6P2H8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM53Q6P2H8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM53Q6P2H8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM53Q6P2H8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM53Q6P2H8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM53Q6P2H8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM53Q6P2H8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM53Q6P2H8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM53Q6P2H8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM53Q6P2H8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM53Q6P2H8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM53Q6P2H8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM53Q6P2H8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM53Q6P2H8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM53Q6P2H8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM53Q6P2H8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM53Q6P2H8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM53Q6P2H8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM53Q6P2H8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM53Q6P2H8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms