Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED27Q6P2C8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED27Q6P2C8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED27Q6P2C8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED27Q6P2C8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED27Q6P2C8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED27Q6P2C8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED27Q6P2C8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED27Q6P2C8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED27Q6P2C8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED27Q6P2C8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED27Q6P2C8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED27Q6P2C8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED27Q6P2C8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED27Q6P2C8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED27Q6P2C8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED27Q6P2C8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED27Q6P2C8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED27Q6P2C8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED27Q6P2C8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED27Q6P2C8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED27Q6P2C8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED27Q6P2C8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED27Q6P2C8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MED27Q6P2C8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED27Q6P2C8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED27Q6P2C8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED27Q6P2C8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED27Q6P2C8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED27Q6P2C8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED27Q6P2C8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED27Q6P2C8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MED27Q6P2C8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MED27Q6P2C8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MED27Q6P2C8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MED27Q6P2C8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MED27Q6P2C8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MED27Q6P2C8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED27Q6P2C8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED27Q6P2C8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED27Q6P2C8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED27Q6P2C8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED27Q6P2C8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED27Q6P2C8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED27Q6P2C8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MED27Q6P2C8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED27Q6P2C8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED27Q6P2C8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED27Q6P2C8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED27Q6P2C8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED27Q6P2C8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED27Q6P2C8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED27Q6P2C8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED27Q6P2C8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MED27Q6P2C8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MED27Q6P2C8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED27Q6P2C8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED27Q6P2C8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED27Q6P2C8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED27Q6P2C8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED27Q6P2C8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED27Q6P2C8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED27Q6P2C8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED27Q6P2C8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED27Q6P2C8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED27Q6P2C8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED27Q6P2C8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED27Q6P2C8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED27Q6P2C8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED27Q6P2C8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED27Q6P2C8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED27Q6P2C8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED27Q6P2C8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED27Q6P2C8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MED27Q6P2C8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED27Q6P2C8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED27Q6P2C8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED27Q6P2C8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED27Q6P2C8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED27Q6P2C8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED27Q6P2C8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED27Q6P2C8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED27Q6P2C8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED27Q6P2C8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED27Q6P2C8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED27Q6P2C8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED27Q6P2C8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MED27Q6P2C8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MED27Q6P2C8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MED27Q6P2C8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MED27Q6P2C8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MED27Q6P2C8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MED27Q6P2C8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED27Q6P2C8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED27Q6P2C8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED27Q6P2C8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MED27Q6P2C8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MED27Q6P2C8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MED27Q6P2C8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MED27Q6P2C8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms