Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPPQ6IPU0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CENPPQ6IPU0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPPQ6IPU0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPPQ6IPU0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPPQ6IPU0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPPQ6IPU0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPPQ6IPU0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPPQ6IPU0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPPQ6IPU0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPPQ6IPU0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPPQ6IPU0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPPQ6IPU0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPPQ6IPU0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPPQ6IPU0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPPQ6IPU0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPPQ6IPU0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPPQ6IPU0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPPQ6IPU0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPPQ6IPU0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPPQ6IPU0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPPQ6IPU0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPPQ6IPU0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPPQ6IPU0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPPQ6IPU0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPPQ6IPU0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPPQ6IPU0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPPQ6IPU0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPPQ6IPU0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPPQ6IPU0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPPQ6IPU0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPPQ6IPU0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPPQ6IPU0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPPQ6IPU0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPPQ6IPU0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPPQ6IPU0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CENPPQ6IPU0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CENPPQ6IPU0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPPQ6IPU0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPPQ6IPU0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CENPPQ6IPU0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CENPPQ6IPU0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CENPPQ6IPU0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CENPPQ6IPU0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CENPPQ6IPU0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CENPPQ6IPU0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CENPPQ6IPU0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CENPPQ6IPU0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CENPPQ6IPU0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CENPPQ6IPU0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CENPPQ6IPU0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CENPPQ6IPU0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CENPPQ6IPU0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CENPPQ6IPU0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CENPPQ6IPU0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CENPPQ6IPU0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CENPPQ6IPU0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CENPPQ6IPU0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CENPPQ6IPU0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CENPPQ6IPU0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPPQ6IPU0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPPQ6IPU0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPPQ6IPU0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CENPPQ6IPU0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CENPPQ6IPU0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CENPPQ6IPU0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPPQ6IPU0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPPQ6IPU0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPPQ6IPU0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPPQ6IPU0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPPQ6IPU0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPPQ6IPU0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CENPPQ6IPU0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CENPPQ6IPU0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPPQ6IPU0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPPQ6IPU0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPPQ6IPU0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPPQ6IPU0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPPQ6IPU0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPPQ6IPU0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPPQ6IPU0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPPQ6IPU0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPPQ6IPU0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPPQ6IPU0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPPQ6IPU0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPPQ6IPU0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPPQ6IPU0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPPQ6IPU0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPPQ6IPU0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPPQ6IPU0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPPQ6IPU0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPPQ6IPU0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPPQ6IPU0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPPQ6IPU0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPPQ6IPU0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPPQ6IPU0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPPQ6IPU0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPPQ6IPU0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPPQ6IPU0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPPQ6IPU0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms