Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RALGAPA1Q6GYQ0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RALGAPA1Q6GYQ0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RALGAPA1Q6GYQ0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RALGAPA1Q6GYQ0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RALGAPA1Q6GYQ0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RALGAPA1Q6GYQ0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RALGAPA1Q6GYQ0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RALGAPA1Q6GYQ0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RALGAPA1Q6GYQ0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RALGAPA1Q6GYQ0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RALGAPA1Q6GYQ0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RALGAPA1Q6GYQ0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RALGAPA1Q6GYQ0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RALGAPA1Q6GYQ0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RALGAPA1Q6GYQ0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RALGAPA1Q6GYQ0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RALGAPA1Q6GYQ0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RALGAPA1Q6GYQ0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RALGAPA1Q6GYQ0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RALGAPA1Q6GYQ0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RALGAPA1Q6GYQ0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RALGAPA1Q6GYQ0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RALGAPA1Q6GYQ0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RALGAPA1Q6GYQ0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RALGAPA1Q6GYQ0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RALGAPA1Q6GYQ0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RALGAPA1Q6GYQ0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RALGAPA1Q6GYQ0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RALGAPA1Q6GYQ0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RALGAPA1Q6GYQ0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RALGAPA1Q6GYQ0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RALGAPA1Q6GYQ0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RALGAPA1Q6GYQ0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RALGAPA1Q6GYQ0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RALGAPA1Q6GYQ0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RALGAPA1Q6GYQ0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RALGAPA1Q6GYQ0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RALGAPA1Q6GYQ0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RALGAPA1Q6GYQ0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RALGAPA1Q6GYQ0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RALGAPA1Q6GYQ0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RALGAPA1Q6GYQ0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RALGAPA1Q6GYQ0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RALGAPA1Q6GYQ0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RALGAPA1Q6GYQ0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RALGAPA1Q6GYQ0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RALGAPA1Q6GYQ0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RALGAPA1Q6GYQ0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RALGAPA1Q6GYQ0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RALGAPA1Q6GYQ0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RALGAPA1Q6GYQ0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RALGAPA1Q6GYQ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RALGAPA1Q6GYQ0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RALGAPA1Q6GYQ0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RALGAPA1Q6GYQ0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RALGAPA1Q6GYQ0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RALGAPA1Q6GYQ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RALGAPA1Q6GYQ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RALGAPA1Q6GYQ0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RALGAPA1Q6GYQ0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RALGAPA1Q6GYQ0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RALGAPA1Q6GYQ0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RALGAPA1Q6GYQ0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RALGAPA1Q6GYQ0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RALGAPA1Q6GYQ0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RALGAPA1Q6GYQ0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RALGAPA1Q6GYQ0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RALGAPA1Q6GYQ0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RALGAPA1Q6GYQ0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RALGAPA1Q6GYQ0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RALGAPA1Q6GYQ0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RALGAPA1Q6GYQ0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RALGAPA1Q6GYQ0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RALGAPA1Q6GYQ0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RALGAPA1Q6GYQ0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RALGAPA1Q6GYQ0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RALGAPA1Q6GYQ0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RALGAPA1Q6GYQ0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RALGAPA1Q6GYQ0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RALGAPA1Q6GYQ0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RALGAPA1Q6GYQ0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RALGAPA1Q6GYQ0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RALGAPA1Q6GYQ0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RALGAPA1Q6GYQ0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RALGAPA1Q6GYQ0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
RALGAPA1Q6GYQ0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RALGAPA1Q6GYQ0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RALGAPA1Q6GYQ0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RALGAPA1Q6GYQ0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RALGAPA1Q6GYQ0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RALGAPA1Q6GYQ0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RALGAPA1Q6GYQ0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms