Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LGALS9CQ6DKI2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LGALS9CQ6DKI2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LGALS9CQ6DKI2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LGALS9CQ6DKI2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LGALS9CQ6DKI2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LGALS9CQ6DKI2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LGALS9CQ6DKI2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LGALS9CQ6DKI2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LGALS9CQ6DKI2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LGALS9CQ6DKI2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LGALS9CQ6DKI2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LGALS9CQ6DKI2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms