Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM236Q5W0B7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM236Q5W0B7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM236Q5W0B7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM236Q5W0B7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM236Q5W0B7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM236Q5W0B7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM236Q5W0B7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMEM236Q5W0B7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM236Q5W0B7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM236Q5W0B7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM236Q5W0B7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM236Q5W0B7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM236Q5W0B7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM236Q5W0B7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM236Q5W0B7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM236Q5W0B7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM236Q5W0B7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM236Q5W0B7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM236Q5W0B7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM236Q5W0B7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM236Q5W0B7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM236Q5W0B7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM236Q5W0B7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM236Q5W0B7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM236Q5W0B7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM236Q5W0B7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM236Q5W0B7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM236Q5W0B7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM236Q5W0B7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM236Q5W0B7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM236Q5W0B7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM236Q5W0B7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM236Q5W0B7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM236Q5W0B7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM236Q5W0B7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM236Q5W0B7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM236Q5W0B7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM236Q5W0B7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM236Q5W0B7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM236Q5W0B7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM236Q5W0B7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM236Q5W0B7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM236Q5W0B7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM236Q5W0B7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM236Q5W0B7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM236Q5W0B7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM236Q5W0B7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM236Q5W0B7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM236Q5W0B7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM236Q5W0B7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM236Q5W0B7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM236Q5W0B7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM236Q5W0B7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM236Q5W0B7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM236Q5W0B7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM236Q5W0B7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM236Q5W0B7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM236Q5W0B7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM236Q5W0B7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM236Q5W0B7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM236Q5W0B7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM236Q5W0B7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM236Q5W0B7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM236Q5W0B7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM236Q5W0B7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM236Q5W0B7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM236Q5W0B7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM236Q5W0B7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM236Q5W0B7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM236Q5W0B7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM236Q5W0B7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM236Q5W0B7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM236Q5W0B7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.2 ms