Protein–RNA interactions for Protein: Q5W041

ARMC3, Armadillo repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC3Q5W041 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARMC3Q5W041 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARMC3Q5W041 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARMC3Q5W041 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARMC3Q5W041 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARMC3Q5W041 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARMC3Q5W041 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARMC3Q5W041 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARMC3Q5W041 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARMC3Q5W041 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARMC3Q5W041 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARMC3Q5W041 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARMC3Q5W041 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARMC3Q5W041 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARMC3Q5W041 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARMC3Q5W041 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARMC3Q5W041 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARMC3Q5W041 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARMC3Q5W041 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARMC3Q5W041 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARMC3Q5W041 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARMC3Q5W041 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARMC3Q5W041 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARMC3Q5W041 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARMC3Q5W041 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARMC3Q5W041 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARMC3Q5W041 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ARMC3Q5W041 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARMC3Q5W041 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARMC3Q5W041 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARMC3Q5W041 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARMC3Q5W041 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARMC3Q5W041 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARMC3Q5W041 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARMC3Q5W041 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARMC3Q5W041 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARMC3Q5W041 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARMC3Q5W041 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARMC3Q5W041 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ARMC3Q5W041 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARMC3Q5W041 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARMC3Q5W041 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARMC3Q5W041 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARMC3Q5W041 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARMC3Q5W041 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARMC3Q5W041 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ARMC3Q5W041 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARMC3Q5W041 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARMC3Q5W041 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARMC3Q5W041 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARMC3Q5W041 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARMC3Q5W041 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARMC3Q5W041 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARMC3Q5W041 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARMC3Q5W041 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARMC3Q5W041 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARMC3Q5W041 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARMC3Q5W041 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARMC3Q5W041 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARMC3Q5W041 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARMC3Q5W041 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARMC3Q5W041 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARMC3Q5W041 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARMC3Q5W041 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARMC3Q5W041 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARMC3Q5W041 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARMC3Q5W041 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARMC3Q5W041 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARMC3Q5W041 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARMC3Q5W041 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARMC3Q5W041 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARMC3Q5W041 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARMC3Q5W041 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARMC3Q5W041 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARMC3Q5W041 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARMC3Q5W041 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARMC3Q5W041 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARMC3Q5W041 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARMC3Q5W041 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARMC3Q5W041 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARMC3Q5W041 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARMC3Q5W041 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARMC3Q5W041 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARMC3Q5W041 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARMC3Q5W041 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARMC3Q5W041 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARMC3Q5W041 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARMC3Q5W041 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARMC3Q5W041 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ARMC3Q5W041 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARMC3Q5W041 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARMC3Q5W041 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARMC3Q5W041 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARMC3Q5W041 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARMC3Q5W041 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ARMC3Q5W041 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARMC3Q5W041 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARMC3Q5W041 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARMC3Q5W041 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARMC3Q5W041 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms