Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32■■■□□ 2.71
ECM29Q5VYK3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32■■■□□ 2.71
ECM29Q5VYK3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ECM29Q5VYK3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ECM29Q5VYK3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ECM29Q5VYK3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ECM29Q5VYK3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ECM29Q5VYK3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ECM29Q5VYK3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ECM29Q5VYK3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ECM29Q5VYK3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ECM29Q5VYK3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ECM29Q5VYK3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ECM29Q5VYK3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ECM29Q5VYK3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ECM29Q5VYK3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ECM29Q5VYK3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
ECM29Q5VYK3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ECM29Q5VYK3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ECM29Q5VYK3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ECM29Q5VYK3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ECM29Q5VYK3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ECM29Q5VYK3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ECM29Q5VYK3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ECM29Q5VYK3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ECM29Q5VYK3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ECM29Q5VYK3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
ECM29Q5VYK3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ECM29Q5VYK3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ECM29Q5VYK3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ECM29Q5VYK3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ECM29Q5VYK3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ECM29Q5VYK3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ECM29Q5VYK3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ECM29Q5VYK3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
ECM29Q5VYK3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ECM29Q5VYK3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
ECM29Q5VYK3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ECM29Q5VYK3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ECM29Q5VYK3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ECM29Q5VYK3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ECM29Q5VYK3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ECM29Q5VYK3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ECM29Q5VYK3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ECM29Q5VYK3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ECM29Q5VYK3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ECM29Q5VYK3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ECM29Q5VYK3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
ECM29Q5VYK3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
ECM29Q5VYK3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
ECM29Q5VYK3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
ECM29Q5VYK3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ECM29Q5VYK3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ECM29Q5VYK3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ECM29Q5VYK3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ECM29Q5VYK3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ECM29Q5VYK3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ECM29Q5VYK3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ECM29Q5VYK3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
ECM29Q5VYK3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ECM29Q5VYK3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ECM29Q5VYK3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ECM29Q5VYK3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ECM29Q5VYK3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ECM29Q5VYK3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ECM29Q5VYK3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ECM29Q5VYK3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ECM29Q5VYK3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ECM29Q5VYK3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
ECM29Q5VYK3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ECM29Q5VYK3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ECM29Q5VYK3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ECM29Q5VYK3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ECM29Q5VYK3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms