Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF17Q5VTA0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRAMEF17Q5VTA0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF17Q5VTA0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF17Q5VTA0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF17Q5VTA0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF17Q5VTA0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF17Q5VTA0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF17Q5VTA0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF17Q5VTA0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF17Q5VTA0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF17Q5VTA0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF17Q5VTA0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF17Q5VTA0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRAMEF17Q5VTA0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF17Q5VTA0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF17Q5VTA0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF17Q5VTA0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF17Q5VTA0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF17Q5VTA0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF17Q5VTA0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF17Q5VTA0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF17Q5VTA0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF17Q5VTA0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF17Q5VTA0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF17Q5VTA0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF17Q5VTA0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF17Q5VTA0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF17Q5VTA0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF17Q5VTA0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF17Q5VTA0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF17Q5VTA0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF17Q5VTA0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF17Q5VTA0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF17Q5VTA0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF17Q5VTA0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF17Q5VTA0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF17Q5VTA0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF17Q5VTA0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF17Q5VTA0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF17Q5VTA0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF17Q5VTA0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF17Q5VTA0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF17Q5VTA0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF17Q5VTA0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF17Q5VTA0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF17Q5VTA0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF17Q5VTA0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF17Q5VTA0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF17Q5VTA0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF17Q5VTA0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF17Q5VTA0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF17Q5VTA0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF17Q5VTA0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF17Q5VTA0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF17Q5VTA0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF17Q5VTA0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF17Q5VTA0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF17Q5VTA0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF17Q5VTA0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF17Q5VTA0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF17Q5VTA0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF17Q5VTA0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF17Q5VTA0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF17Q5VTA0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF17Q5VTA0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF17Q5VTA0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF17Q5VTA0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF17Q5VTA0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF17Q5VTA0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF17Q5VTA0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF17Q5VTA0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF17Q5VTA0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF17Q5VTA0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF17Q5VTA0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF17Q5VTA0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF17Q5VTA0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF17Q5VTA0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF17Q5VTA0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF17Q5VTA0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF17Q5VTA0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF17Q5VTA0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF17Q5VTA0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF17Q5VTA0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF17Q5VTA0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF17Q5VTA0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF17Q5VTA0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF17Q5VTA0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF17Q5VTA0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF17Q5VTA0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF17Q5VTA0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF17Q5VTA0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF17Q5VTA0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF17Q5VTA0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF17Q5VTA0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF17Q5VTA0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF17Q5VTA0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF17Q5VTA0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF17Q5VTA0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF17Q5VTA0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms