Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBAP2Q5T6F2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBAP2Q5T6F2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBAP2Q5T6F2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBAP2Q5T6F2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBAP2Q5T6F2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
UBAP2Q5T6F2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBAP2Q5T6F2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBAP2Q5T6F2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBAP2Q5T6F2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBAP2Q5T6F2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBAP2Q5T6F2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBAP2Q5T6F2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBAP2Q5T6F2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBAP2Q5T6F2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBAP2Q5T6F2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBAP2Q5T6F2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBAP2Q5T6F2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBAP2Q5T6F2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBAP2Q5T6F2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBAP2Q5T6F2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBAP2Q5T6F2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBAP2Q5T6F2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBAP2Q5T6F2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBAP2Q5T6F2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBAP2Q5T6F2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBAP2Q5T6F2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBAP2Q5T6F2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
UBAP2Q5T6F2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBAP2Q5T6F2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
UBAP2Q5T6F2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBAP2Q5T6F2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBAP2Q5T6F2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBAP2Q5T6F2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBAP2Q5T6F2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBAP2Q5T6F2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBAP2Q5T6F2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBAP2Q5T6F2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBAP2Q5T6F2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBAP2Q5T6F2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBAP2Q5T6F2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBAP2Q5T6F2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBAP2Q5T6F2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
UBAP2Q5T6F2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
UBAP2Q5T6F2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBAP2Q5T6F2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBAP2Q5T6F2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBAP2Q5T6F2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBAP2Q5T6F2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBAP2Q5T6F2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBAP2Q5T6F2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBAP2Q5T6F2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBAP2Q5T6F2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBAP2Q5T6F2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBAP2Q5T6F2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBAP2Q5T6F2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBAP2Q5T6F2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBAP2Q5T6F2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBAP2Q5T6F2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBAP2Q5T6F2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBAP2Q5T6F2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBAP2Q5T6F2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBAP2Q5T6F2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBAP2Q5T6F2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBAP2Q5T6F2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBAP2Q5T6F2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBAP2Q5T6F2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
UBAP2Q5T6F2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBAP2Q5T6F2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
UBAP2Q5T6F2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBAP2Q5T6F2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBAP2Q5T6F2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBAP2Q5T6F2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBAP2Q5T6F2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBAP2Q5T6F2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBAP2Q5T6F2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBAP2Q5T6F2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
UBAP2Q5T6F2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBAP2Q5T6F2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBAP2Q5T6F2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBAP2Q5T6F2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBAP2Q5T6F2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBAP2Q5T6F2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBAP2Q5T6F2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBAP2Q5T6F2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBAP2Q5T6F2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBAP2Q5T6F2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBAP2Q5T6F2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBAP2Q5T6F2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBAP2Q5T6F2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBAP2Q5T6F2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBAP2Q5T6F2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBAP2Q5T6F2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBAP2Q5T6F2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBAP2Q5T6F2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBAP2Q5T6F2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBAP2Q5T6F2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBAP2Q5T6F2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBAP2Q5T6F2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBAP2Q5T6F2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms