Protein–RNA interactions for Protein: Q5T655

CFAP58, Cilia- and flagella-associated protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP58Q5T655 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP58Q5T655 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP58Q5T655 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP58Q5T655 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP58Q5T655 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CFAP58Q5T655 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP58Q5T655 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP58Q5T655 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP58Q5T655 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP58Q5T655 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CFAP58Q5T655 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CFAP58Q5T655 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP58Q5T655 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP58Q5T655 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP58Q5T655 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP58Q5T655 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP58Q5T655 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP58Q5T655 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP58Q5T655 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP58Q5T655 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP58Q5T655 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP58Q5T655 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP58Q5T655 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP58Q5T655 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP58Q5T655 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP58Q5T655 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP58Q5T655 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP58Q5T655 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP58Q5T655 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP58Q5T655 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP58Q5T655 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP58Q5T655 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP58Q5T655 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP58Q5T655 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP58Q5T655 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP58Q5T655 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP58Q5T655 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP58Q5T655 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP58Q5T655 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP58Q5T655 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP58Q5T655 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP58Q5T655 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP58Q5T655 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP58Q5T655 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP58Q5T655 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP58Q5T655 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP58Q5T655 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP58Q5T655 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP58Q5T655 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP58Q5T655 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP58Q5T655 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP58Q5T655 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP58Q5T655 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP58Q5T655 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP58Q5T655 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP58Q5T655 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP58Q5T655 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP58Q5T655 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP58Q5T655 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP58Q5T655 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP58Q5T655 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP58Q5T655 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP58Q5T655 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP58Q5T655 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP58Q5T655 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP58Q5T655 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP58Q5T655 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP58Q5T655 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP58Q5T655 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP58Q5T655 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFAP58Q5T655 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFAP58Q5T655 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CFAP58Q5T655 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CFAP58Q5T655 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFAP58Q5T655 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFAP58Q5T655 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFAP58Q5T655 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFAP58Q5T655 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFAP58Q5T655 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFAP58Q5T655 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFAP58Q5T655 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFAP58Q5T655 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFAP58Q5T655 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFAP58Q5T655 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP58Q5T655 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP58Q5T655 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP58Q5T655 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP58Q5T655 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP58Q5T655 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFAP58Q5T655 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFAP58Q5T655 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFAP58Q5T655 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFAP58Q5T655 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFAP58Q5T655 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP58Q5T655 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP58Q5T655 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP58Q5T655 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP58Q5T655 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP58Q5T655 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP58Q5T655 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms