Protein–RNA interactions for Protein: Q5T481

RBM20, RNA-binding protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM20Q5T481 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM20Q5T481 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM20Q5T481 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM20Q5T481 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM20Q5T481 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM20Q5T481 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM20Q5T481 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM20Q5T481 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM20Q5T481 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM20Q5T481 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM20Q5T481 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM20Q5T481 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM20Q5T481 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM20Q5T481 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM20Q5T481 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM20Q5T481 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM20Q5T481 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM20Q5T481 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RBM20Q5T481 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RBM20Q5T481 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM20Q5T481 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM20Q5T481 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM20Q5T481 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM20Q5T481 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM20Q5T481 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM20Q5T481 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM20Q5T481 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM20Q5T481 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM20Q5T481 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM20Q5T481 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM20Q5T481 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM20Q5T481 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM20Q5T481 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM20Q5T481 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM20Q5T481 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM20Q5T481 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM20Q5T481 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM20Q5T481 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM20Q5T481 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM20Q5T481 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM20Q5T481 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM20Q5T481 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM20Q5T481 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM20Q5T481 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM20Q5T481 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM20Q5T481 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM20Q5T481 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM20Q5T481 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM20Q5T481 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM20Q5T481 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM20Q5T481 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM20Q5T481 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM20Q5T481 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM20Q5T481 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM20Q5T481 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM20Q5T481 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM20Q5T481 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM20Q5T481 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM20Q5T481 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM20Q5T481 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM20Q5T481 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM20Q5T481 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM20Q5T481 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM20Q5T481 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM20Q5T481 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBM20Q5T481 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBM20Q5T481 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBM20Q5T481 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RBM20Q5T481 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM20Q5T481 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM20Q5T481 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM20Q5T481 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM20Q5T481 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM20Q5T481 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM20Q5T481 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM20Q5T481 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM20Q5T481 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM20Q5T481 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM20Q5T481 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM20Q5T481 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM20Q5T481 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM20Q5T481 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM20Q5T481 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM20Q5T481 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM20Q5T481 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM20Q5T481 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM20Q5T481 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM20Q5T481 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM20Q5T481 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM20Q5T481 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM20Q5T481 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM20Q5T481 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM20Q5T481 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM20Q5T481 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM20Q5T481 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM20Q5T481 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM20Q5T481 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM20Q5T481 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM20Q5T481 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM20Q5T481 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms