Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIN3Q5JUX0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIN3Q5JUX0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIN3Q5JUX0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIN3Q5JUX0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIN3Q5JUX0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIN3Q5JUX0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIN3Q5JUX0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIN3Q5JUX0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIN3Q5JUX0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIN3Q5JUX0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIN3Q5JUX0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIN3Q5JUX0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN3Q5JUX0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN3Q5JUX0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN3Q5JUX0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN3Q5JUX0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN3Q5JUX0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN3Q5JUX0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIN3Q5JUX0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIN3Q5JUX0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIN3Q5JUX0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIN3Q5JUX0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIN3Q5JUX0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIN3Q5JUX0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIN3Q5JUX0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIN3Q5JUX0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIN3Q5JUX0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIN3Q5JUX0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIN3Q5JUX0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIN3Q5JUX0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIN3Q5JUX0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIN3Q5JUX0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIN3Q5JUX0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIN3Q5JUX0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIN3Q5JUX0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIN3Q5JUX0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIN3Q5JUX0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIN3Q5JUX0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIN3Q5JUX0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIN3Q5JUX0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIN3Q5JUX0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIN3Q5JUX0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIN3Q5JUX0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIN3Q5JUX0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPIN3Q5JUX0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN3Q5JUX0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN3Q5JUX0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN3Q5JUX0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN3Q5JUX0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN3Q5JUX0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN3Q5JUX0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN3Q5JUX0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN3Q5JUX0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN3Q5JUX0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIN3Q5JUX0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIN3Q5JUX0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIN3Q5JUX0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIN3Q5JUX0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIN3Q5JUX0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIN3Q5JUX0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIN3Q5JUX0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIN3Q5JUX0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIN3Q5JUX0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN3Q5JUX0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN3Q5JUX0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIN3Q5JUX0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPIN3Q5JUX0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPIN3Q5JUX0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIN3Q5JUX0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIN3Q5JUX0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIN3Q5JUX0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIN3Q5JUX0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIN3Q5JUX0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIN3Q5JUX0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIN3Q5JUX0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIN3Q5JUX0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIN3Q5JUX0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIN3Q5JUX0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIN3Q5JUX0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN3Q5JUX0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN3Q5JUX0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN3Q5JUX0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIN3Q5JUX0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIN3Q5JUX0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIN3Q5JUX0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms