Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PHLDA2Q53GA4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHLDA2Q53GA4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHLDA2Q53GA4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHLDA2Q53GA4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHLDA2Q53GA4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms