Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PHLDA2Q53GA4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHLDA2Q53GA4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHLDA2Q53GA4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHLDA2Q53GA4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHLDA2Q53GA4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHLDA2Q53GA4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHLDA2Q53GA4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHLDA2Q53GA4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHLDA2Q53GA4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms