Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFTN2Q52LD8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFTN2Q52LD8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RFTN2Q52LD8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFTN2Q52LD8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFTN2Q52LD8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFTN2Q52LD8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFTN2Q52LD8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFTN2Q52LD8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFTN2Q52LD8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFTN2Q52LD8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFTN2Q52LD8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFTN2Q52LD8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFTN2Q52LD8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFTN2Q52LD8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFTN2Q52LD8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFTN2Q52LD8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFTN2Q52LD8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFTN2Q52LD8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFTN2Q52LD8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFTN2Q52LD8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFTN2Q52LD8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFTN2Q52LD8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFTN2Q52LD8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFTN2Q52LD8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFTN2Q52LD8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFTN2Q52LD8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFTN2Q52LD8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFTN2Q52LD8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFTN2Q52LD8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFTN2Q52LD8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFTN2Q52LD8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFTN2Q52LD8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RFTN2Q52LD8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFTN2Q52LD8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RFTN2Q52LD8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFTN2Q52LD8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFTN2Q52LD8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFTN2Q52LD8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFTN2Q52LD8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RFTN2Q52LD8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFTN2Q52LD8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFTN2Q52LD8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RFTN2Q52LD8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFTN2Q52LD8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFTN2Q52LD8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFTN2Q52LD8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFTN2Q52LD8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFTN2Q52LD8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFTN2Q52LD8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFTN2Q52LD8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFTN2Q52LD8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFTN2Q52LD8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFTN2Q52LD8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RFTN2Q52LD8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFTN2Q52LD8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFTN2Q52LD8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RFTN2Q52LD8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFTN2Q52LD8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RFTN2Q52LD8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFTN2Q52LD8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFTN2Q52LD8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFTN2Q52LD8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFTN2Q52LD8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFTN2Q52LD8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFTN2Q52LD8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFTN2Q52LD8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFTN2Q52LD8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFTN2Q52LD8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFTN2Q52LD8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFTN2Q52LD8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFTN2Q52LD8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFTN2Q52LD8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFTN2Q52LD8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFTN2Q52LD8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RFTN2Q52LD8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RFTN2Q52LD8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFTN2Q52LD8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFTN2Q52LD8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFTN2Q52LD8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFTN2Q52LD8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFTN2Q52LD8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFTN2Q52LD8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFTN2Q52LD8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFTN2Q52LD8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFTN2Q52LD8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFTN2Q52LD8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms