Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXU2

PABPC1L, Polyadenylate-binding protein 1-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PABPC1LQ4VXU2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PABPC1LQ4VXU2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PABPC1LQ4VXU2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PABPC1LQ4VXU2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PABPC1LQ4VXU2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PABPC1LQ4VXU2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PABPC1LQ4VXU2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PABPC1LQ4VXU2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PABPC1LQ4VXU2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PABPC1LQ4VXU2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PABPC1LQ4VXU2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PABPC1LQ4VXU2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PABPC1LQ4VXU2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PABPC1LQ4VXU2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PABPC1LQ4VXU2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PABPC1LQ4VXU2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PABPC1LQ4VXU2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PABPC1LQ4VXU2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PABPC1LQ4VXU2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PABPC1LQ4VXU2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PABPC1LQ4VXU2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PABPC1LQ4VXU2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PABPC1LQ4VXU2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms