Protein–RNA interactions for Protein: Q49A88

CCDC14, Coiled-coil domain-containing protein 14, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC14Q49A88 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC14Q49A88 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC14Q49A88 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC14Q49A88 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC14Q49A88 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC14Q49A88 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC14Q49A88 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC14Q49A88 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC14Q49A88 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC14Q49A88 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC14Q49A88 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC14Q49A88 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC14Q49A88 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC14Q49A88 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC14Q49A88 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC14Q49A88 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC14Q49A88 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC14Q49A88 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC14Q49A88 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC14Q49A88 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC14Q49A88 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC14Q49A88 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC14Q49A88 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC14Q49A88 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC14Q49A88 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC14Q49A88 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC14Q49A88 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC14Q49A88 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC14Q49A88 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC14Q49A88 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC14Q49A88 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC14Q49A88 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC14Q49A88 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC14Q49A88 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC14Q49A88 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC14Q49A88 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC14Q49A88 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC14Q49A88 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC14Q49A88 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC14Q49A88 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC14Q49A88 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC14Q49A88 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC14Q49A88 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC14Q49A88 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC14Q49A88 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC14Q49A88 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC14Q49A88 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC14Q49A88 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC14Q49A88 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC14Q49A88 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC14Q49A88 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC14Q49A88 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC14Q49A88 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC14Q49A88 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC14Q49A88 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC14Q49A88 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC14Q49A88 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC14Q49A88 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC14Q49A88 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC14Q49A88 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC14Q49A88 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC14Q49A88 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC14Q49A88 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC14Q49A88 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC14Q49A88 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC14Q49A88 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC14Q49A88 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC14Q49A88 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC14Q49A88 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC14Q49A88 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC14Q49A88 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC14Q49A88 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC14Q49A88 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC14Q49A88 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC14Q49A88 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC14Q49A88 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC14Q49A88 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC14Q49A88 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC14Q49A88 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC14Q49A88 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC14Q49A88 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC14Q49A88 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC14Q49A88 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC14Q49A88 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC14Q49A88 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC14Q49A88 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC14Q49A88 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC14Q49A88 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC14Q49A88 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC14Q49A88 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC14Q49A88 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC14Q49A88 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC14Q49A88 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC14Q49A88 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC14Q49A88 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC14Q49A88 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC14Q49A88 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC14Q49A88 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC14Q49A88 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC14Q49A88 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms