Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
SLFNL1Q499Z3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SLFNL1Q499Z3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SLFNL1Q499Z3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SLFNL1Q499Z3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SLFNL1Q499Z3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.89■■■□□ 2.69
SLFNL1Q499Z3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SLFNL1Q499Z3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SLFNL1Q499Z3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SLFNL1Q499Z3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SLFNL1Q499Z3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SLFNL1Q499Z3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SLFNL1Q499Z3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
SLFNL1Q499Z3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SLFNL1Q499Z3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SLFNL1Q499Z3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SLFNL1Q499Z3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SLFNL1Q499Z3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SLFNL1Q499Z3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SLFNL1Q499Z3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SLFNL1Q499Z3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SLFNL1Q499Z3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SLFNL1Q499Z3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SLFNL1Q499Z3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SLFNL1Q499Z3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SLFNL1Q499Z3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SLFNL1Q499Z3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SLFNL1Q499Z3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SLFNL1Q499Z3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SLFNL1Q499Z3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
SLFNL1Q499Z3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SLFNL1Q499Z3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SLFNL1Q499Z3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SLFNL1Q499Z3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SLFNL1Q499Z3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SLFNL1Q499Z3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SLFNL1Q499Z3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SLFNL1Q499Z3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SLFNL1Q499Z3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SLFNL1Q499Z3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SLFNL1Q499Z3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
SLFNL1Q499Z3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
SLFNL1Q499Z3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SLFNL1Q499Z3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SLFNL1Q499Z3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SLFNL1Q499Z3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SLFNL1Q499Z3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SLFNL1Q499Z3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SLFNL1Q499Z3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SLFNL1Q499Z3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SLFNL1Q499Z3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
SLFNL1Q499Z3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SLFNL1Q499Z3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SLFNL1Q499Z3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SLFNL1Q499Z3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SLFNL1Q499Z3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SLFNL1Q499Z3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SLFNL1Q499Z3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SLFNL1Q499Z3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SLFNL1Q499Z3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SLFNL1Q499Z3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SLFNL1Q499Z3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SLFNL1Q499Z3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SLFNL1Q499Z3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
SLFNL1Q499Z3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SLFNL1Q499Z3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SLFNL1Q499Z3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SLFNL1Q499Z3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SLFNL1Q499Z3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SLFNL1Q499Z3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SLFNL1Q499Z3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SLFNL1Q499Z3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SLFNL1Q499Z3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SLFNL1Q499Z3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SLFNL1Q499Z3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SLFNL1Q499Z3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SLFNL1Q499Z3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SLFNL1Q499Z3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SLFNL1Q499Z3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SLFNL1Q499Z3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
SLFNL1Q499Z3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SLFNL1Q499Z3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SLFNL1Q499Z3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLFNL1Q499Z3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLFNL1Q499Z3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLFNL1Q499Z3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLFNL1Q499Z3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLFNL1Q499Z3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SLFNL1Q499Z3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SLFNL1Q499Z3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
SLFNL1Q499Z3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SLFNL1Q499Z3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SLFNL1Q499Z3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SLFNL1Q499Z3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SLFNL1Q499Z3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SLFNL1Q499Z3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
SLFNL1Q499Z3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SLFNL1Q499Z3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SLFNL1Q499Z3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SLFNL1Q499Z3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms