Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBRG1Q3YBR2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBRG1Q3YBR2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TBRG1Q3YBR2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TBRG1Q3YBR2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TBRG1Q3YBR2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TBRG1Q3YBR2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TBRG1Q3YBR2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TBRG1Q3YBR2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TBRG1Q3YBR2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TBRG1Q3YBR2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TBRG1Q3YBR2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TBRG1Q3YBR2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TBRG1Q3YBR2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TBRG1Q3YBR2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TBRG1Q3YBR2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TBRG1Q3YBR2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms