Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ13

WDR72, WD repeat-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR72Q3MJ13 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
WDR72Q3MJ13 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WDR72Q3MJ13 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WDR72Q3MJ13 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WDR72Q3MJ13 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
WDR72Q3MJ13 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
WDR72Q3MJ13 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
WDR72Q3MJ13 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
WDR72Q3MJ13 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
WDR72Q3MJ13 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
WDR72Q3MJ13 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR72Q3MJ13 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR72Q3MJ13 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms