Protein–RNA interactions for Protein: Q3KRA9

ALKBH6, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH6Q3KRA9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALKBH6Q3KRA9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ALKBH6Q3KRA9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALKBH6Q3KRA9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALKBH6Q3KRA9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALKBH6Q3KRA9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALKBH6Q3KRA9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALKBH6Q3KRA9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALKBH6Q3KRA9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALKBH6Q3KRA9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALKBH6Q3KRA9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALKBH6Q3KRA9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALKBH6Q3KRA9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALKBH6Q3KRA9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALKBH6Q3KRA9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALKBH6Q3KRA9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALKBH6Q3KRA9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALKBH6Q3KRA9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALKBH6Q3KRA9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALKBH6Q3KRA9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALKBH6Q3KRA9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALKBH6Q3KRA9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALKBH6Q3KRA9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALKBH6Q3KRA9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ALKBH6Q3KRA9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALKBH6Q3KRA9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALKBH6Q3KRA9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALKBH6Q3KRA9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALKBH6Q3KRA9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ALKBH6Q3KRA9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALKBH6Q3KRA9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALKBH6Q3KRA9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALKBH6Q3KRA9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALKBH6Q3KRA9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALKBH6Q3KRA9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALKBH6Q3KRA9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALKBH6Q3KRA9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALKBH6Q3KRA9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALKBH6Q3KRA9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ALKBH6Q3KRA9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALKBH6Q3KRA9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALKBH6Q3KRA9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALKBH6Q3KRA9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALKBH6Q3KRA9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALKBH6Q3KRA9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALKBH6Q3KRA9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALKBH6Q3KRA9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALKBH6Q3KRA9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ALKBH6Q3KRA9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALKBH6Q3KRA9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALKBH6Q3KRA9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALKBH6Q3KRA9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALKBH6Q3KRA9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALKBH6Q3KRA9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALKBH6Q3KRA9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALKBH6Q3KRA9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALKBH6Q3KRA9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALKBH6Q3KRA9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALKBH6Q3KRA9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALKBH6Q3KRA9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALKBH6Q3KRA9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALKBH6Q3KRA9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALKBH6Q3KRA9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALKBH6Q3KRA9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALKBH6Q3KRA9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALKBH6Q3KRA9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALKBH6Q3KRA9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALKBH6Q3KRA9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALKBH6Q3KRA9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALKBH6Q3KRA9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALKBH6Q3KRA9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALKBH6Q3KRA9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ALKBH6Q3KRA9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALKBH6Q3KRA9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALKBH6Q3KRA9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms