Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA7

RSPO1, R-spondin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO1Q2MKA7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RSPO1Q2MKA7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RSPO1Q2MKA7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSPO1Q2MKA7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSPO1Q2MKA7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPO1Q2MKA7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPO1Q2MKA7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPO1Q2MKA7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPO1Q2MKA7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPO1Q2MKA7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSPO1Q2MKA7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSPO1Q2MKA7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSPO1Q2MKA7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RSPO1Q2MKA7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RSPO1Q2MKA7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RSPO1Q2MKA7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RSPO1Q2MKA7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RSPO1Q2MKA7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RSPO1Q2MKA7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RSPO1Q2MKA7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RSPO1Q2MKA7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RSPO1Q2MKA7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RSPO1Q2MKA7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSPO1Q2MKA7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSPO1Q2MKA7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSPO1Q2MKA7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSPO1Q2MKA7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSPO1Q2MKA7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSPO1Q2MKA7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSPO1Q2MKA7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSPO1Q2MKA7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSPO1Q2MKA7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSPO1Q2MKA7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSPO1Q2MKA7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSPO1Q2MKA7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPO1Q2MKA7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPO1Q2MKA7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPO1Q2MKA7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPO1Q2MKA7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPO1Q2MKA7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPO1Q2MKA7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPO1Q2MKA7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPO1Q2MKA7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPO1Q2MKA7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RSPO1Q2MKA7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RSPO1Q2MKA7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPO1Q2MKA7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPO1Q2MKA7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPO1Q2MKA7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPO1Q2MKA7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPO1Q2MKA7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPO1Q2MKA7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPO1Q2MKA7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO1Q2MKA7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO1Q2MKA7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO1Q2MKA7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO1Q2MKA7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO1Q2MKA7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPO1Q2MKA7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPO1Q2MKA7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPO1Q2MKA7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPO1Q2MKA7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPO1Q2MKA7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPO1Q2MKA7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPO1Q2MKA7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPO1Q2MKA7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPO1Q2MKA7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPO1Q2MKA7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPO1Q2MKA7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPO1Q2MKA7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPO1Q2MKA7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPO1Q2MKA7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPO1Q2MKA7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPO1Q2MKA7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPO1Q2MKA7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPO1Q2MKA7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPO1Q2MKA7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPO1Q2MKA7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPO1Q2MKA7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RSPO1Q2MKA7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPO1Q2MKA7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPO1Q2MKA7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPO1Q2MKA7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPO1Q2MKA7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPO1Q2MKA7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPO1Q2MKA7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPO1Q2MKA7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPO1Q2MKA7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RSPO1Q2MKA7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RSPO1Q2MKA7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPO1Q2MKA7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPO1Q2MKA7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPO1Q2MKA7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPO1Q2MKA7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPO1Q2MKA7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPO1Q2MKA7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPO1Q2MKA7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPO1Q2MKA7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPO1Q2MKA7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPO1Q2MKA7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms