Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
QSER1Q2KHR3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
QSER1Q2KHR3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
QSER1Q2KHR3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
QSER1Q2KHR3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
QSER1Q2KHR3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
QSER1Q2KHR3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
QSER1Q2KHR3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
QSER1Q2KHR3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
QSER1Q2KHR3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
QSER1Q2KHR3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
QSER1Q2KHR3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
QSER1Q2KHR3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
QSER1Q2KHR3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
QSER1Q2KHR3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
QSER1Q2KHR3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
QSER1Q2KHR3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
QSER1Q2KHR3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
QSER1Q2KHR3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
QSER1Q2KHR3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
QSER1Q2KHR3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
QSER1Q2KHR3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
QSER1Q2KHR3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
QSER1Q2KHR3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
QSER1Q2KHR3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
QSER1Q2KHR3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
QSER1Q2KHR3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
QSER1Q2KHR3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
QSER1Q2KHR3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
QSER1Q2KHR3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
QSER1Q2KHR3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
QSER1Q2KHR3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
QSER1Q2KHR3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
QSER1Q2KHR3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
QSER1Q2KHR3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
QSER1Q2KHR3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
QSER1Q2KHR3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
QSER1Q2KHR3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
QSER1Q2KHR3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
QSER1Q2KHR3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
QSER1Q2KHR3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
QSER1Q2KHR3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
QSER1Q2KHR3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
QSER1Q2KHR3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
QSER1Q2KHR3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
QSER1Q2KHR3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
QSER1Q2KHR3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
QSER1Q2KHR3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
QSER1Q2KHR3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
QSER1Q2KHR3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
QSER1Q2KHR3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
QSER1Q2KHR3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
QSER1Q2KHR3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
QSER1Q2KHR3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
QSER1Q2KHR3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
QSER1Q2KHR3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
QSER1Q2KHR3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
QSER1Q2KHR3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
QSER1Q2KHR3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
QSER1Q2KHR3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
QSER1Q2KHR3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
QSER1Q2KHR3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
QSER1Q2KHR3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
QSER1Q2KHR3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
QSER1Q2KHR3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
QSER1Q2KHR3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
QSER1Q2KHR3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
QSER1Q2KHR3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
QSER1Q2KHR3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
QSER1Q2KHR3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
QSER1Q2KHR3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
QSER1Q2KHR3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
QSER1Q2KHR3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
QSER1Q2KHR3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
QSER1Q2KHR3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
QSER1Q2KHR3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
QSER1Q2KHR3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
QSER1Q2KHR3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
QSER1Q2KHR3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
QSER1Q2KHR3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
QSER1Q2KHR3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
QSER1Q2KHR3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
QSER1Q2KHR3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
QSER1Q2KHR3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
QSER1Q2KHR3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
QSER1Q2KHR3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
QSER1Q2KHR3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
QSER1Q2KHR3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
QSER1Q2KHR3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
QSER1Q2KHR3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
QSER1Q2KHR3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
QSER1Q2KHR3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
QSER1Q2KHR3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
QSER1Q2KHR3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
QSER1Q2KHR3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
QSER1Q2KHR3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
QSER1Q2KHR3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
QSER1Q2KHR3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
QSER1Q2KHR3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
QSER1Q2KHR3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms