Protein–RNA interactions for Protein: Q17RC7

EXOC3L4, Exocyst complex component 3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOC3L4Q17RC7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EXOC3L4Q17RC7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EXOC3L4Q17RC7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
EXOC3L4Q17RC7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EXOC3L4Q17RC7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EXOC3L4Q17RC7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EXOC3L4Q17RC7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EXOC3L4Q17RC7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EXOC3L4Q17RC7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EXOC3L4Q17RC7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EXOC3L4Q17RC7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EXOC3L4Q17RC7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EXOC3L4Q17RC7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EXOC3L4Q17RC7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EXOC3L4Q17RC7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EXOC3L4Q17RC7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EXOC3L4Q17RC7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EXOC3L4Q17RC7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EXOC3L4Q17RC7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EXOC3L4Q17RC7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EXOC3L4Q17RC7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EXOC3L4Q17RC7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EXOC3L4Q17RC7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EXOC3L4Q17RC7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EXOC3L4Q17RC7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EXOC3L4Q17RC7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EXOC3L4Q17RC7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOC3L4Q17RC7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOC3L4Q17RC7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EXOC3L4Q17RC7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EXOC3L4Q17RC7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EXOC3L4Q17RC7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EXOC3L4Q17RC7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EXOC3L4Q17RC7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EXOC3L4Q17RC7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EXOC3L4Q17RC7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EXOC3L4Q17RC7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EXOC3L4Q17RC7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EXOC3L4Q17RC7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EXOC3L4Q17RC7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EXOC3L4Q17RC7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EXOC3L4Q17RC7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EXOC3L4Q17RC7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EXOC3L4Q17RC7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EXOC3L4Q17RC7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EXOC3L4Q17RC7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EXOC3L4Q17RC7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EXOC3L4Q17RC7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EXOC3L4Q17RC7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EXOC3L4Q17RC7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EXOC3L4Q17RC7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EXOC3L4Q17RC7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EXOC3L4Q17RC7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EXOC3L4Q17RC7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EXOC3L4Q17RC7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
EXOC3L4Q17RC7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
EXOC3L4Q17RC7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EXOC3L4Q17RC7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EXOC3L4Q17RC7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOC3L4Q17RC7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOC3L4Q17RC7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOC3L4Q17RC7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOC3L4Q17RC7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOC3L4Q17RC7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EXOC3L4Q17RC7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EXOC3L4Q17RC7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EXOC3L4Q17RC7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EXOC3L4Q17RC7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EXOC3L4Q17RC7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EXOC3L4Q17RC7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOC3L4Q17RC7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOC3L4Q17RC7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOC3L4Q17RC7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOC3L4Q17RC7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOC3L4Q17RC7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EXOC3L4Q17RC7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EXOC3L4Q17RC7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EXOC3L4Q17RC7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EXOC3L4Q17RC7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EXOC3L4Q17RC7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EXOC3L4Q17RC7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EXOC3L4Q17RC7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EXOC3L4Q17RC7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EXOC3L4Q17RC7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EXOC3L4Q17RC7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EXOC3L4Q17RC7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EXOC3L4Q17RC7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EXOC3L4Q17RC7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EXOC3L4Q17RC7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EXOC3L4Q17RC7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EXOC3L4Q17RC7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EXOC3L4Q17RC7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EXOC3L4Q17RC7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EXOC3L4Q17RC7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EXOC3L4Q17RC7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EXOC3L4Q17RC7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EXOC3L4Q17RC7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOC3L4Q17RC7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOC3L4Q17RC7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOC3L4Q17RC7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms