Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DUSP6Q16828 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DUSP6Q16828 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DUSP6Q16828 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DUSP6Q16828 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DUSP6Q16828 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DUSP6Q16828 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DUSP6Q16828 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DUSP6Q16828 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DUSP6Q16828 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DUSP6Q16828 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DUSP6Q16828 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUSP6Q16828 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUSP6Q16828 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUSP6Q16828 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUSP6Q16828 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DUSP6Q16828 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DUSP6Q16828 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DUSP6Q16828 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DUSP6Q16828 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DUSP6Q16828 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUSP6Q16828 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUSP6Q16828 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUSP6Q16828 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUSP6Q16828 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DUSP6Q16828 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUSP6Q16828 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUSP6Q16828 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DUSP6Q16828 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DUSP6Q16828 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DUSP6Q16828 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DUSP6Q16828 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DUSP6Q16828 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DUSP6Q16828 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DUSP6Q16828 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DUSP6Q16828 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DUSP6Q16828 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DUSP6Q16828 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DUSP6Q16828 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DUSP6Q16828 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DUSP6Q16828 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DUSP6Q16828 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DUSP6Q16828 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DUSP6Q16828 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DUSP6Q16828 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DUSP6Q16828 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DUSP6Q16828 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DUSP6Q16828 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DUSP6Q16828 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DUSP6Q16828 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DUSP6Q16828 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DUSP6Q16828 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DUSP6Q16828 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DUSP6Q16828 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DUSP6Q16828 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DUSP6Q16828 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DUSP6Q16828 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DUSP6Q16828 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DUSP6Q16828 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DUSP6Q16828 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DUSP6Q16828 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DUSP6Q16828 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
DUSP6Q16828 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DUSP6Q16828 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DUSP6Q16828 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DUSP6Q16828 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DUSP6Q16828 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DUSP6Q16828 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DUSP6Q16828 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
DUSP6Q16828 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DUSP6Q16828 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DUSP6Q16828 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DUSP6Q16828 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DUSP6Q16828 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DUSP6Q16828 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DUSP6Q16828 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DUSP6Q16828 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DUSP6Q16828 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DUSP6Q16828 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DUSP6Q16828 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DUSP6Q16828 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DUSP6Q16828 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DUSP6Q16828 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DUSP6Q16828 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUSP6Q16828 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DUSP6Q16828 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DUSP6Q16828 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DUSP6Q16828 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUSP6Q16828 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUSP6Q16828 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUSP6Q16828 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUSP6Q16828 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUSP6Q16828 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUSP6Q16828 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUSP6Q16828 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUSP6Q16828 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
DUSP6Q16828 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUSP6Q16828 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUSP6Q16828 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUSP6Q16828 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
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