Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
STX1AQ16623 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
STX1AQ16623 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
STX1AQ16623 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
STX1AQ16623 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
STX1AQ16623 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STX1AQ16623 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
STX1AQ16623 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
STX1AQ16623 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
STX1AQ16623 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STX1AQ16623 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STX1AQ16623 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
STX1AQ16623 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
STX1AQ16623 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
STX1AQ16623 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
STX1AQ16623 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
STX1AQ16623 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
STX1AQ16623 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
STX1AQ16623 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
STX1AQ16623 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
STX1AQ16623 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
STX1AQ16623 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
STX1AQ16623 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
STX1AQ16623 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STX1AQ16623 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
STX1AQ16623 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
STX1AQ16623 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
STX1AQ16623 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
STX1AQ16623 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
STX1AQ16623 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
STX1AQ16623 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
STX1AQ16623 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
STX1AQ16623 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
STX1AQ16623 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
STX1AQ16623 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
STX1AQ16623 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STX1AQ16623 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
STX1AQ16623 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STX1AQ16623 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STX1AQ16623 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
STX1AQ16623 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STX1AQ16623 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STX1AQ16623 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
STX1AQ16623 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STX1AQ16623 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
STX1AQ16623 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STX1AQ16623 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
STX1AQ16623 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
STX1AQ16623 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
STX1AQ16623 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STX1AQ16623 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STX1AQ16623 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
STX1AQ16623 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
STX1AQ16623 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
STX1AQ16623 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
STX1AQ16623 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
STX1AQ16623 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
STX1AQ16623 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
STX1AQ16623 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
STX1AQ16623 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
STX1AQ16623 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
STX1AQ16623 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STX1AQ16623 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STX1AQ16623 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STX1AQ16623 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
STX1AQ16623 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STX1AQ16623 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
STX1AQ16623 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STX1AQ16623 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STX1AQ16623 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STX1AQ16623 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STX1AQ16623 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STX1AQ16623 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STX1AQ16623 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STX1AQ16623 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STX1AQ16623 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
STX1AQ16623 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STX1AQ16623 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STX1AQ16623 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STX1AQ16623 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
STX1AQ16623 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STX1AQ16623 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STX1AQ16623 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STX1AQ16623 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STX1AQ16623 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
STX1AQ16623 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STX1AQ16623 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
STX1AQ16623 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STX1AQ16623 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STX1AQ16623 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STX1AQ16623 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STX1AQ16623 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STX1AQ16623 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STX1AQ16623 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STX1AQ16623 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STX1AQ16623 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
STX1AQ16623 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STX1AQ16623 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STX1AQ16623 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
STX1AQ16623 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms