Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SGCBQ16585 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGCBQ16585 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGCBQ16585 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGCBQ16585 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGCBQ16585 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGCBQ16585 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGCBQ16585 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGCBQ16585 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGCBQ16585 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGCBQ16585 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCBQ16585 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCBQ16585 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCBQ16585 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCBQ16585 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGCBQ16585 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGCBQ16585 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGCBQ16585 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGCBQ16585 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGCBQ16585 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SGCBQ16585 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGCBQ16585 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGCBQ16585 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGCBQ16585 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGCBQ16585 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGCBQ16585 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGCBQ16585 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGCBQ16585 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGCBQ16585 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGCBQ16585 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGCBQ16585 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGCBQ16585 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGCBQ16585 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGCBQ16585 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGCBQ16585 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGCBQ16585 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGCBQ16585 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGCBQ16585 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SGCBQ16585 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGCBQ16585 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGCBQ16585 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGCBQ16585 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGCBQ16585 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGCBQ16585 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCBQ16585 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCBQ16585 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCBQ16585 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCBQ16585 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms